168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0974 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0974  chromosomal replication initiator DnaA  100 
 
 
215 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.400417  hitchhiker  0.0000000135124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  28.44 
 
 
442 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.93 
 
 
456 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.03 
 
 
441 aa  58.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.49 
 
 
481 aa  55.8  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.49 
 
 
481 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000310067  unclonable  0.000054574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0002  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.35 
 
 
470 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000188551  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0211  transposition helper protein, IS21 family  29.8 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  32.92 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 
460 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  32.92 
 
 
453 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 
458 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  30.32 
 
 
440 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  28.02 
 
 
451 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  29.68 
 
 
440 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.54 
 
 
454 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000297027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  31.65 
 
 
450 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  28.48 
 
 
436 aa  49.3  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  29.68 
 
 
440 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  31.45 
 
 
440 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.8 
 
 
591 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1263  transposase/IS protein  29.38 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00267464  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.92 
 
 
587 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  30 
 
 
453 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1531  IstB ATP binding domain-containing protein  26.75 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0025  IstB ATP binding domain-containing protein  29.01 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1297  IstB ATP binding domain-containing protein  29.01 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2217  IstB ATP binding domain-containing protein  29.01 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  30.49 
 
 
347 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.92 
 
 
454 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3317  Chromosomal replication initiator DnaA  27.52 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.159079  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  27.33 
 
 
435 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  30.13 
 
 
481 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.59 
 
 
446 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  32.35 
 
 
478 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  25.89 
 
 
477 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  30.13 
 
 
480 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  30.26 
 
 
436 aa  45.8  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1274  hypothetical protein  27.03 
 
 
230 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0001  chromosomal replication initiation protein  29.63 
 
 
440 aa  45.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0001  chromosomal replication initiation protein  29.7 
 
 
440 aa  45.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  28.78 
 
 
445 aa  45.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  23.62 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0682  IstB ATP binding domain-containing protein  24.1 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.566484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.68 
 
 
461 aa  45.4  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  33.09 
 
 
472 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0929  Chromosomal replication initiator DnaA  26.87 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6289100000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1412  chromosomal replication initiator, DnaA  30.41 
 
 
241 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  25.73 
 
 
443 aa  45.1  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0562  AAA ATPase  26.77 
 
 
254 aa  45.1  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107485 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1831  ATPase  23.64 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00675411  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3952  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  31.54 
 
 
469 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  29.5 
 
 
449 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0030  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0078  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0338  IstB domain protein ATP-binding protein  25.85 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  33.49 
 
 
518 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0137  IstB ATP binding domain-containing protein  29.24 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.784901  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2832  IstB ATP binding domain-containing protein  29.24 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443511  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  24.24 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  27.59 
 
 
441 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  27.6 
 
 
482 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.97 
 
 
566 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  27.33 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2587  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.160971  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1905  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3279  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2526  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2961  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3217  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000088143  normal  0.0723332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  27.1 
 
 
457 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  27.1 
 
 
457 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0023  hypothetical protein  22.66 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0484  hypothetical protein  22.66 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4126  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.142881  normal  0.387354 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  28.77 
 
 
436 aa  43.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  27.33 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2678  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0328651 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2024  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1293  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3486  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3445  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3153  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.640291  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0035  IS21 family transposition helper protein  26.22 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0995  IS21 family transposition helper protein  26.22 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2227  IS21 family transposition helper protein  26.22 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2922  IS21 family transposition helper protein  26.22 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3339  IS21 family transposition helper protein  26.22 
 
 
264 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  27.33 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1050  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0434314  normal  0.0157914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
525 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0002  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307192 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0016  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0135  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0293303 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0315  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.107694  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0449  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000734492 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0531  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0444538  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0635  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.144534  normal  0.136264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0688  transposase/IS protein  25.81 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>