More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1834 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  802    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  62.99 
 
 
377 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  60.42 
 
 
380 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.42 
 
 
378 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  58.38 
 
 
378 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.16 
 
 
378 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.64 
 
 
380 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
383 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.89 
 
 
384 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.19 
 
 
381 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.53 
 
 
391 aa  315  7e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
383 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
383 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
383 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
383 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.15 
 
 
383 aa  314  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.38 
 
 
383 aa  312  6.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.96 
 
 
383 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.49 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  38.93 
 
 
385 aa  237  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.29 
 
 
385 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  35.4 
 
 
384 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  37.63 
 
 
383 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.3 
 
 
405 aa  196  7e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.72 
 
 
379 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.95 
 
 
384 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01905  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.27 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.95 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.93 
 
 
402 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.18 
 
 
380 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.44 
 
 
383 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.24 
 
 
377 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.13 
 
 
383 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  31.66 
 
 
379 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.03 
 
 
396 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2854  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.66 
 
 
385 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.715109  hitchhiker  0.0000000460252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.66 
 
 
379 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1491  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1527  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1399  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2662  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.18 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.553599  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  31.15 
 
 
410 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1377  butyryl-CoA dehydrogenase  30.18 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0267981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2476  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.48 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.185436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2769  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.92 
 
 
385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.329604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2176  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.87 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2781  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.15 
 
 
385 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  30.89 
 
 
410 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.34 
 
 
384 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  30.75 
 
 
378 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2595  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 
385 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.58 
 
 
400 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.24 
 
 
383 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.72 
 
 
389 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
394 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.13 
 
 
380 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3055  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.92 
 
 
379 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350853  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1941  butyryl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 
385 aa  169  5e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 
410 aa  169  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1679  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.37 
 
 
385 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.26 
 
 
381 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
379 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.91 
 
 
404 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.91 
 
 
404 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.91 
 
 
404 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.45 
 
 
378 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.295515  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 
642 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1340  butyryl-CoA dehydrogenase  29.13 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.92296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.53 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.05 
 
 
394 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.24 
 
 
388 aa  166  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1669  butyryl-CoA dehydrogenase  29.12 
 
 
385 aa  166  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.260436  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0858  butyryl-CoA dehydrogenase  30.43 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661231  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.28 
 
 
379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001547  branched-chain acyl-CoA dehydrogenase  29.74 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.91 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.88 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.26 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.91 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  30.18 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  30 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>