More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4600 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  793    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  69.97 
 
 
383 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
383 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.91 
 
 
383 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  55.91 
 
 
383 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
383 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
383 aa  461  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
383 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.92 
 
 
391 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
383 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  458  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  56.96 
 
 
383 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.41 
 
 
381 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.91 
 
 
384 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  55.64 
 
 
383 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  47.11 
 
 
377 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 
380 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.74 
 
 
378 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
378 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.21 
 
 
378 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  44.36 
 
 
380 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.51 
 
 
383 aa  324  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  41.88 
 
 
385 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  43.49 
 
 
383 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.32 
 
 
385 aa  300  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
384 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.11 
 
 
394 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 
384 aa  279  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.01 
 
 
386 aa  229  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.91 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.45 
 
 
380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
382 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.77 
 
 
404 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.77 
 
 
404 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.77 
 
 
404 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 
405 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.11 
 
 
383 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.77 
 
 
400 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 
385 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  34.22 
 
 
388 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.12 
 
 
388 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
410 aa  205  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.55 
 
 
380 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.55 
 
 
381 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  32.46 
 
 
410 aa  203  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.41 
 
 
399 aa  202  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4286  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.78 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.330894 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.7 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.81 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.41 
 
 
395 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.43 
 
 
379 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2482  butyryl-CoA dehydrogenase  35.32 
 
 
395 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.29 
 
 
383 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  32.19 
 
 
410 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.25 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.4 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  32.02 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  31.28 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1932  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.41 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  31.76 
 
 
381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.77 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.69 
 
 
379 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.3 
 
 
379 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  31.85 
 
 
380 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.95 
 
 
389 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.59 
 
 
382 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4257  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.36 
 
 
376 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0626  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.62 
 
 
386 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000265202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0733  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.73 
 
 
377 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0459  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.51 
 
 
376 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.672922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1604  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.48 
 
 
387 aa  193  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  31.59 
 
 
378 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.45 
 
 
380 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.281355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.58 
 
 
379 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 
390 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 
390 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2198  acyl-CoA dehydrogenase-like  29.75 
 
 
379 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.583783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.41 
 
 
380 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>