More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4037 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 		 380 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 		 380 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 		 380 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  93.12 
 
 		 378 aa  742    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.42 
 
 		 377 aa  650    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 378 aa  787    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  93.12 
 
 		 378 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 		 380 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  78.95 
 
 		 380 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  80.26 
 
 		 380 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  59.16 
 
 		 383 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 381 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  47.38 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  47.38 
 
 		 383 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.19 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.41 
 
 		 383 aa  345  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  45.43 
 
 		 383 aa  332  6e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.74 
 
 		 380 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.08 
 
 		 391 aa  328  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.98 
 
 		 385 aa  260  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  38.85 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  35.08 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  33.77 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.29 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.71 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.79 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.66 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.42 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  31.41 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1608  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.55 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.72 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.2 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.61 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.97 
 
 		 380 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  29.58 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.68 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.2 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.11 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  30.16 
 
 		 377 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.94 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.89 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.68 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  29.66 
 
 		 381 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.49 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.97 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.89 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.43 
 
 		 389 aa  179  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1669  butyryl-CoA dehydrogenase  30.69 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.260436  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  30.63 
 
 		 379 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  30.37 
 
 		 379 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  30.63 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.66 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.77 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.12 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.4 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.66 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.53 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.47 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  30.03 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.58 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3744  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.43 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.39 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3817  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.43 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.420794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3756  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.43 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  0.282187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>