More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_09220  acyl-CoA dehydrogenase  80.16 
 
 
385 aa  644    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605884  normal  0.299074 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08800  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
384 aa  798    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.320154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1840  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  57.96 
 
 
384 aa  481  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0618853  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1861  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.48 
 
 
394 aa  352  7e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.128157  normal  0.323931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0310  putative acyl-CoA dehydrogenase  49.35 
 
 
383 aa  328  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1468  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.72 
 
 
383 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.283366  normal  0.0792636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1487  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.72 
 
 
383 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00971669 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1816  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.72 
 
 
383 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.297013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1452  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.72 
 
 
383 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.215854  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1987  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.46 
 
 
383 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143395  hitchhiker  0.00158428 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1947  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0267578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2411  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1936  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0137614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1898  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1911  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
383 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01664  predicted acyl-CoA dehydrogenase  42.93 
 
 
383 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1501  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.19 
 
 
384 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01653  hypothetical protein  42.93 
 
 
383 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1388  putative acyl-CoA dehydrogenase  43.08 
 
 
383 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.977333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2878  putative acyl-CoA dehydrogenase  42.86 
 
 
391 aa  299  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1403  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.99 
 
 
381 aa  292  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4600  putative acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 
380 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1021  putative acyl-CoA dehydrogenase  40.93 
 
 
383 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3098  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.01 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.509328  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0570  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  37.76 
 
 
377 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.741044  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1849  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.27 
 
 
382 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00043  crotonobetaine reductase subunit II, FAD-binding  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3560  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3616  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0669979 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00042  hypothetical protein  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0043  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0041  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0040  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.55 
 
 
380 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0077  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0081  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124381  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0080  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0079  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 
380 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0999313  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4037  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  33.77 
 
 
378 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3228  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  32.98 
 
 
378 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08750  acyl-CoA dehydrogenase  32.82 
 
 
386 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.456879  normal  0.674074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2675  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  32.46 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1834  crotonobetainyl-CoA dehydrogenase  35.4 
 
 
383 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09270  acyl-CoA dehydrogenase  34.56 
 
 
388 aa  196  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.21 
 
 
388 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.25 
 
 
379 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.65 
 
 
380 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1590  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.76 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.51 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.99 
 
 
380 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  32.13 
 
 
379 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  32.13 
 
 
379 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  32.13 
 
 
379 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  32.22 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  32.73 
 
 
379 aa  182  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  32.22 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  32.73 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2909  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.72 
 
 
389 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  32.13 
 
 
379 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0249  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.7 
 
 
383 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.538468  normal  0.417839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.25 
 
 
380 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  31.96 
 
 
379 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0234  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.03 
 
 
386 aa  179  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2442  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.53 
 
 
395 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.830058  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0319  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.27 
 
 
383 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.339666  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4210  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.08 
 
 
399 aa  176  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0538412  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
381 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.44 
 
 
385 aa  176  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5206  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  31.47 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.652072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  30.71 
 
 
381 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  30.97 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6335  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.33 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1052  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.87 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.97 
 
 
376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2429  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.82 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.62219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.44 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region:Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal  28.95 
 
 
378 aa  173  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.71414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.01 
 
 
379 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3931  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.02 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.543045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0668  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.5 
 
 
379 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1175  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.73 
 
 
381 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.65 
 
 
381 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3267  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.14 
 
 
379 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.691288  normal  0.607013 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.97 
 
 
379 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.82 
 
 
376 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5538  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.05 
 
 
384 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  30.65 
 
 
379 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4358  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
381 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0892384  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1777  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.13 
 
 
383 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0345355  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2056  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 
377 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.232194  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0812  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.19 
 
 
393 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0446  butyryl-CoA dehydrogenase  30.23 
 
 
385 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>