132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3322 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  100 
 
 
795 aa  1650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  65.29 
 
 
293 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 
827 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  30.36 
 
 
570 aa  177  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  24.72 
 
 
821 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  29 
 
 
712 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  28.99 
 
 
835 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  27.09 
 
 
849 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  24.75 
 
 
814 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  26.4 
 
 
830 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  27.14 
 
 
845 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  26.12 
 
 
829 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  25.84 
 
 
823 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  26.38 
 
 
743 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  22.57 
 
 
847 aa  97.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  22.83 
 
 
847 aa  95.9  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  26.47 
 
 
846 aa  95.1  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 
760 aa  95.1  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.91 
 
 
729 aa  93.2  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  24.06 
 
 
826 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  25.82 
 
 
822 aa  92.8  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.8 
 
 
1230 aa  92.4  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
1241 aa  92.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  26.64 
 
 
830 aa  92  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.73 
 
 
1060 aa  90.9  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  24.49 
 
 
835 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  24.92 
 
 
831 aa  90.1  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
1234 aa  89  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.67 
 
 
1361 aa  89  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  25.97 
 
 
841 aa  87.8  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  24 
 
 
850 aa  87.8  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.25 
 
 
1285 aa  87  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.04 
 
 
1324 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  25.25 
 
 
825 aa  85.1  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25.21 
 
 
1239 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.57 
 
 
1253 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  25 
 
 
790 aa  81.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  26.05 
 
 
789 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.24 
 
 
1086 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 
1153 aa  78.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  24.25 
 
 
844 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  24.25 
 
 
844 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  23.78 
 
 
872 aa  75.9  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  22.73 
 
 
847 aa  75.1  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  23.45 
 
 
869 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  25.62 
 
 
858 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4136  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1110 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
1172 aa  73.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4602  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25.81 
 
 
1340 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823259  normal  0.0573734 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  24.17 
 
 
792 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.97 
 
 
1261 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 
1262 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.32 
 
 
1262 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 
1106 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 
1065 aa  69.7  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  22.76 
 
 
839 aa  68.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.97 
 
 
1333 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  23.9 
 
 
855 aa  65.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0871  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  25.71 
 
 
1078 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  25.79 
 
 
858 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  25.79 
 
 
858 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  24.58 
 
 
870 aa  61.2  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.4 
 
 
1078 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22270  subtilisin-like serine protease  30.34 
 
 
405 aa  60.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324587  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  23.26 
 
 
737 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  25.22 
 
 
740 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.62 
 
 
429 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1292  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.71 
 
 
913 aa  57  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  22.48 
 
 
738 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  24.78 
 
 
847 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  32.69 
 
 
577 aa  54.7  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.29 
 
 
440 aa  54.7  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
298 aa  54.7  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  29.71 
 
 
513 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  24.33 
 
 
740 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  30.2 
 
 
298 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
597 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  24.77 
 
 
835 aa  52.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0754  alkaline serine protease  21.55 
 
 
567 aa  52  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.721726  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
320 aa  51.6  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.01 
 
 
391 aa  51.6  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 
320 aa  51.6  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1065  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.14 
 
 
442 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 
689 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
688 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.38 
 
 
429 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  44.64 
 
 
472 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
577 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2240  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.3 
 
 
429 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8079  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.51 
 
 
386 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  26.98 
 
 
611 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.9 
 
 
627 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0198  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.42 
 
 
418 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.81 
 
 
638 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  21.59 
 
 
376 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.65 
 
 
576 aa  48.5  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.61 
 
 
1054 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.92 
 
 
397 aa  48.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.22 
 
 
398 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>