36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1586 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  99.06 
 
 
847 aa  1738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  64.09 
 
 
829 aa  1137    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  36.54 
 
 
830 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  38.56 
 
 
789 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  36.7 
 
 
841 aa  486  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  38.75 
 
 
822 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  35.78 
 
 
823 aa  482  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  35.46 
 
 
830 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  36.82 
 
 
846 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  36.46 
 
 
835 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  34.86 
 
 
831 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  35.08 
 
 
826 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  34.11 
 
 
849 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  35.15 
 
 
814 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  33.95 
 
 
845 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  36.33 
 
 
825 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  31.31 
 
 
835 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  31.15 
 
 
847 aa  320  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  31.06 
 
 
850 aa  320  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  30.96 
 
 
847 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  29.4 
 
 
851 aa  287  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  40.78 
 
 
376 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  30.26 
 
 
472 aa  190  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25.75 
 
 
712 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  22.57 
 
 
795 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  25.68 
 
 
821 aa  77.8  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.51 
 
 
827 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  27.11 
 
 
792 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  23.51 
 
 
293 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  24.66 
 
 
872 aa  60.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  23.02 
 
 
869 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  23.77 
 
 
425 aa  52  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  24.25 
 
 
790 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  23.76 
 
 
844 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  23.76 
 
 
844 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>