49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1641 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  100 
 
 
570 aa  1154    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.27 
 
 
827 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  30.62 
 
 
795 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  28.32 
 
 
712 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  30.64 
 
 
743 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  26.54 
 
 
821 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  25.76 
 
 
858 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  25.76 
 
 
858 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 
760 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  25.19 
 
 
858 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  26.22 
 
 
851 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  25.29 
 
 
822 aa  67.4  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  25.17 
 
 
841 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  24.9 
 
 
789 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  25.91 
 
 
826 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.21 
 
 
729 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  26.03 
 
 
790 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  27.4 
 
 
839 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  27.87 
 
 
872 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  23.29 
 
 
823 aa  60.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  23.69 
 
 
814 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  24.7 
 
 
844 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  24.7 
 
 
844 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  26.25 
 
 
835 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  24.81 
 
 
830 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  26.47 
 
 
847 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  25.89 
 
 
869 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  25.23 
 
 
792 aa  54.7  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  25.69 
 
 
855 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4754  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 
445 aa  50.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00404816  hitchhiker  0.000540965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  25.19 
 
 
830 aa  50.8  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  24.6 
 
 
825 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  26 
 
 
472 aa  50.4  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  24.13 
 
 
850 aa  49.7  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  28 
 
 
611 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 
576 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.52 
 
 
431 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  25.2 
 
 
870 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
638 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  28.03 
 
 
835 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  24.35 
 
 
829 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9917  hypothetical protein  67.74 
 
 
50 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1004  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.08 
 
 
396 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.774887  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  21.08 
 
 
740 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.27 
 
 
597 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.21 
 
 
1324 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  30.92 
 
 
513 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48496  predicted protein  27.69 
 
 
460 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.264136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
510 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>