17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3110 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1240    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  31.13 
 
 		 869 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  31.54 
 
 		 872 aa  223  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  29.38 
 
 		 870 aa  212  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  32.96 
 
 		 844 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  32.96 
 
 		 844 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  29.72 
 
 		 855 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  28.87 
 
 		 792 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  30.7 
 
 		 858 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  30.71 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  30.71 
 
 		 858 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  29.03 
 
 		 839 aa  173  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  24.91 
 
 		 821 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  28 
 
 		 570 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  26.98 
 
 		 795 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.92 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  26.6 
 
 		 846 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>