20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3821 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  100 
 
 		 870 aa  1803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  34.65 
 
 		 869 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  33.84 
 
 		 872 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  35.39 
 
 		 844 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  35.39 
 
 		 844 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  32.65 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  32.65 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  32.35 
 
 		 858 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  32.51 
 
 		 855 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  30.38 
 
 		 839 aa  362  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  29.42 
 
 		 792 aa  307  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  28.79 
 
 		 611 aa  205  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  22.51 
 
 		 821 aa  72.4  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.71 
 
 		 712 aa  71.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  24.58 
 
 		 795 aa  65.5  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  20.98 
 
 		 845 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  23.4 
 
 		 829 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  25.2 
 
 		 570 aa  48.5  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5724  hypothetical protein  31.65 
 
 		 152 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.34 
 
 		 729 aa  45.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>