30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3853 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  89.23 
 
 
849 aa  1539    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  100 
 
 
845 aa  1718    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  41.49 
 
 
835 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  41.94 
 
 
841 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  37.74 
 
 
830 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  37.28 
 
 
826 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  41.23 
 
 
789 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  38.1 
 
 
830 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  41.37 
 
 
822 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  35.74 
 
 
829 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  39.2 
 
 
846 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  36.3 
 
 
823 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  36.86 
 
 
825 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  36.11 
 
 
831 aa  452  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  33.94 
 
 
847 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  33.95 
 
 
847 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  33.77 
 
 
814 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  35.23 
 
 
835 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  31.54 
 
 
850 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  33.25 
 
 
847 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  31.37 
 
 
847 aa  320  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  31.23 
 
 
851 aa  300  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  40.81 
 
 
376 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  34.88 
 
 
472 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  27.14 
 
 
795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
827 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25 
 
 
712 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  22.71 
 
 
821 aa  80.1  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  23.19 
 
 
869 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  22.95 
 
 
872 aa  56.2  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>