36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3864 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1753    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  63.97 
 
 		 829 aa  1139    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  99.06 
 
 		 847 aa  1738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  35.79 
 
 		 830 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  38.82 
 
 		 789 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  37.05 
 
 		 835 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  38.87 
 
 		 822 aa  486  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  36.61 
 
 		 841 aa  485  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  36.76 
 
 		 846 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  35.46 
 
 		 830 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  35.71 
 
 		 823 aa  479  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  34.86 
 
 		 831 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  35.2 
 
 		 826 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  34.27 
 
 		 849 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  33.94 
 
 		 845 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  35.15 
 
 		 814 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  36.33 
 
 		 825 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  32.66 
 
 		 835 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  31.12 
 
 		 847 aa  319  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  29.52 
 
 		 850 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  30.71 
 
 		 847 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  29.49 
 
 		 851 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  41.04 
 
 		 376 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  30.26 
 
 		 472 aa  191  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  25.62 
 
 		 712 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  22.83 
 
 		 795 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  25.47 
 
 		 821 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 827 aa  75.1  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  27.11 
 
 		 792 aa  67.4  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  23.2 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  22.52 
 
 		 869 aa  62.4  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  26.46 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  24.63 
 
 		 790 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  24.36 
 
 		 844 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  24.36 
 
 		 844 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  23.77 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>