14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5592 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  65.29 
 
 		 795 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 		 827 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  23.51 
 
 		 847 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  23.23 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  23.2 
 
 		 847 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  27.14 
 
 		 821 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  23.57 
 
 		 829 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  22.81 
 
 		 849 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.73 
 
 		 712 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  33.85 
 
 		 858 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  21.9 
 
 		 830 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  32.26 
 
 		 858 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  32.26 
 
 		 858 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>