42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5328 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  64.09 
 
 		 847 aa  1137    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1696    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  63.97 
 
 		 847 aa  1139    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  38.48 
 
 		 841 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  39.49 
 
 		 846 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  41.44 
 
 		 789 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  36.88 
 
 		 830 aa  512  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  38.22 
 
 		 830 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  38.97 
 
 		 835 aa  509  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  37.29 
 
 		 823 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  37.68 
 
 		 825 aa  492  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  40.33 
 
 		 822 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  35.74 
 
 		 845 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  35.99 
 
 		 849 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  35.5 
 
 		 831 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  35.51 
 
 		 826 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  35.36 
 
 		 814 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  35.73 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  32.29 
 
 		 850 aa  351  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  31.24 
 
 		 847 aa  331  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  30.41 
 
 		 847 aa  308  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  31.11 
 
 		 851 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  40.79 
 
 		 376 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  30.79 
 
 		 472 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  26.05 
 
 		 712 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  26.12 
 
 		 795 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.41 
 
 		 827 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  25.73 
 
 		 869 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  23.88 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  24.68 
 
 		 844 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  24.68 
 
 		 844 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  23.9 
 
 		 855 aa  54.7  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  23.57 
 
 		 293 aa  54.7  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  23.04 
 
 		 790 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  21.5 
 
 		 821 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  25.25 
 
 		 872 aa  51.2  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.77 
 
 		 743 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  22.9 
 
 		 743 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  24.64 
 
 		 570 aa  45.8  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.29 
 
 		 1262 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 		 1262 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  22.43 
 
 		 425 aa  45.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>