35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2253 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  44.51 
 
 		 830 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  44.77 
 
 		 835 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  100 
 
 		 823 aa  1705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  42.67 
 
 		 841 aa  628  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  42.28 
 
 		 830 aa  599  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  41.71 
 
 		 822 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  43.59 
 
 		 789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  40.8 
 
 		 826 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  38.49 
 
 		 846 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  37.29 
 
 		 829 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  36.24 
 
 		 831 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  35.78 
 
 		 847 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  35.71 
 
 		 847 aa  489  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  38.18 
 
 		 825 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  36.34 
 
 		 845 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  36.61 
 
 		 849 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  36.61 
 
 		 814 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  36.68 
 
 		 835 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  31.84 
 
 		 847 aa  363  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  31.48 
 
 		 850 aa  361  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  32.06 
 
 		 851 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  31.33 
 
 		 847 aa  334  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  45.48 
 
 		 376 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  37.01 
 
 		 472 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  26.16 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  25.84 
 
 		 795 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  23.46 
 
 		 821 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  23.29 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  21.64 
 
 		 790 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  24.44 
 
 		 869 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  24.09 
 
 		 844 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  24.09 
 
 		 844 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.16 
 
 		 729 aa  51.6  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  23.92 
 
 		 743 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>