25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2658 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  100 
 
 
839 aa  1678    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0098  hypothetical protein  32.16 
 
 
872 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  30.02 
 
 
869 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3821  hypothetical protein  30.38 
 
 
870 aa  351  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0310113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4461  hypothetical protein  32.72 
 
 
858 aa  343  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1466  hypothetical protein  32.49 
 
 
858 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.467243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1489  hypothetical protein  32.49 
 
 
858 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0748  hypothetical protein  31.7 
 
 
855 aa  316  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.298605  normal  0.440798 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5977  hypothetical protein  32.03 
 
 
844 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5574  hypothetical protein  32.03 
 
 
844 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.218076  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5900  hypothetical protein  31.38 
 
 
792 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3110  hypothetical protein  31.22 
 
 
611 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.464764  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  22.76 
 
 
795 aa  68.9  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  23.16 
 
 
425 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  27.4 
 
 
570 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  25.03 
 
 
738 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.56 
 
 
712 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.2 
 
 
729 aa  52  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  26.3 
 
 
739 aa  51.6  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  28.11 
 
 
821 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.87 
 
 
827 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  24.62 
 
 
790 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  24.83 
 
 
740 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.3 
 
 
742 aa  45.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6419  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.54 
 
 
729 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0229441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>