29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1970 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  67.07 
 
 		 737 aa  1031    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 738 aa  1507    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  78.68 
 
 		 742 aa  1177    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  87.13 
 
 		 739 aa  1319    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  77.94 
 
 		 740 aa  1191    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  45.92 
 
 		 740 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.89 
 
 		 744 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.62 
 
 		 743 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6419  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.79 
 
 		 729 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0229441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2297  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.2 
 
 		 706 aa  361  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735492  hitchhiker  0.00060401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  33.1 
 
 		 425 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 		 729 aa  94.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0499  hypothetical protein  24.21 
 
 		 755 aa  92.8  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0510016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.21 
 
 		 760 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1252  subtilisin-like serine protease  23.09 
 
 		 751 aa  80.5  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.950247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  23.3 
 
 		 790 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  26.53 
 
 		 743 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0292  hypothetical protein  23.72 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00116575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.02 
 
 		 1078 aa  60.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  23.08 
 
 		 712 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  25.03 
 
 		 839 aa  58.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  22.48 
 
 		 795 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  23.05 
 
 		 821 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7320  hypothetical protein  23.73 
 
 		 749 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.34 
 
 		 1060 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3319  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 		 429 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  22.91 
 
 		 835 aa  45.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.08 
 
 		 1230 aa  43.9  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0871  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.7 
 
 		 1078 aa  44.3  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>