30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2443 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5697  hypothetical protein  66.4 
 
 
737 aa  1032    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00635  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  77.22 
 
 
742 aa  1160    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3739  hypothetical protein  75.68 
 
 
740 aa  1165    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2443  hypothetical protein  100 
 
 
739 aa  1517    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1970  hypothetical protein  87.13 
 
 
738 aa  1339    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  46.6 
 
 
740 aa  629  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.2 
 
 
744 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1082  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 
743 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6419  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.13 
 
 
729 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0229441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2297  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.47 
 
 
706 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.735492  hitchhiker  0.00060401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0295  hypothetical protein  32.95 
 
 
425 aa  193  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0359768  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.95 
 
 
729 aa  94.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1252  subtilisin-like serine protease  22.89 
 
 
751 aa  89  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.950247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3058  hypothetical protein  22.22 
 
 
790 aa  85.1  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0499  hypothetical protein  22.18 
 
 
755 aa  85.1  0.000000000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0510016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2107  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
760 aa  77.8  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0292  hypothetical protein  24.85 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00116575  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  24.63 
 
 
712 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  25.09 
 
 
743 aa  62  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.02 
 
 
1078 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2658  hypothetical protein  26.3 
 
 
839 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000653199  hitchhiker  0.00786959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.58 
 
 
1060 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7320  hypothetical protein  25.64 
 
 
749 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
1172 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  23.7 
 
 
830 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  21.24 
 
 
821 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.88 
 
 
1230 aa  45.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.43 
 
 
1234 aa  44.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0871  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.88 
 
 
1078 aa  44.3  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0512  hypothetical protein  26.53 
 
 
835 aa  44.3  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0576205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>