More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_3102 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3102  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.711314  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  29.37 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  28.67 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  26.25 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  28.67 
 
 		 461 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  24.77 
 
 		 442 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1710  magnesium transporter  27.24 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1255  magnesium transporter  26.76 
 
 		 445 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.029906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1450  magnesium transporter  26.42 
 
 		 445 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.103194  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  26.82 
 
 		 462 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1690  magnesium transporter  28.35 
 
 		 452 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0394876 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  24.58 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  24.67 
 
 		 450 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1939  magnesium transporter  28.48 
 
 		 444 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0382273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  28 
 
 		 458 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1145  magnesium transporter  29.55 
 
 		 457 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03198  Mg/Co/Ni transporter MgtE (contains CBS domain)  24.23 
 
 		 452 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000340775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0337  MgtE integral membrane region  26.45 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0645  magnesium transporter  25.87 
 
 		 452 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0824163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0971  magnesium transporter  29.32 
 
 		 457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  27.3 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  29.46 
 
 		 449 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  27.3 
 
 		 449 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1785  divalent cation transporter  28.57 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2620  magnesium transport protein  27.24 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.475029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  28.05 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3382  magnesium transporter  25.99 
 
 		 454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.363371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2935  magnesium transporter  27.39 
 
 		 457 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2896  magnesium transporter  25.96 
 
 		 453 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0679732  normal  0.300943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2000  magnesium transporter  25.47 
 
 		 454 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1056  magnesium transporter  28.83 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0801577  hitchhiker  0.0000813528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3521  magnesium transporter  28.83 
 
 		 457 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3300  magnesium transporter  28.83 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3396  magnesium transporter  28.53 
 
 		 457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1083  magnesium transporter  26.03 
 
 		 471 aa  109  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.939247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  26.4 
 
 		 482 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  26.3 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0721  magnesium transporter  26.5 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52460  putative Mg transporter MgtE  26.24 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4599  putative Mg transporter MgtE  26.24 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4471  magnesium transporter  26.06 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.223346 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1444  magnesium transporter  26.06 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0516873  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3976  magnesium transporter  26.06 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2718  magnesium transporter  26.95 
 
 		 452 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  27.5 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1742  magnesium transporter  25.08 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  24.54 
 
 		 454 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2770  putative magnesium transporter  24.46 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.304585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3760  magnesium transporter  26.76 
 
 		 480 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00964036  normal  0.880674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  24.85 
 
 		 454 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  24.85 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3552  divalent cation transporter  25.62 
 
 		 480 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0662808  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  24.46 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  26.41 
 
 		 454 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2180  MgtE integral membrane region  24.05 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  26.59 
 
 		 443 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1342  divalent cation transporter  27.64 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.09733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  25.44 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1033  magnesium transporter  23.75 
 
 		 473 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  24.54 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1846  magnesium transporter  25.27 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1082  divalent cation transporter  26.67 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  24.23 
 
 		 454 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4271  divalent cation transporter  24.91 
 
 		 480 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000733148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  24.23 
 
 		 454 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  24.23 
 
 		 454 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1904  magnesium transporter  23.29 
 
 		 462 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  23.93 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  25.24 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  27.56 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1567  magnesium transporter  25.51 
 
 		 481 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2899  magnesium transporter  25.27 
 
 		 480 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  23.93 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  26.06 
 
 		 468 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  26.06 
 
 		 468 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  26.22 
 
 		 468 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  26.24 
 
 		 451 aa  99.4  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2723  magnesium transporter  24.44 
 
 		 462 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.310199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  24.6 
 
 		 468 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0493  magnesium transporter  26.95 
 
 		 451 aa  97.1  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.862314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3093  magnesium transporter  25.96 
 
 		 454 aa  97.1  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  27.85 
 
 		 445 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2363  magnesium transporter  26.44 
 
 		 454 aa  96.7  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1897  Mg/Co/Ni transporter, MgtE  24.25 
 
 		 444 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1318  magnesium transporter  27.06 
 
 		 458 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3682  magnesium transporter  24.75 
 
 		 480 aa  96.3  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0546  magnesium transporter  24.25 
 
 		 459 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0696  magnesium transporter  25.17 
 
 		 470 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  25.08 
 
 		 451 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02217  magnesium transporter  22.46 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0994421  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1269  magnesium transporter  24.46 
 
 		 465 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0779643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  25.53 
 
 		 469 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  25.35 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0726  magnesium transporter  25.66 
 
 		 442 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.376481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3316  magnesium transporter  25.7 
 
 		 455 aa  94  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0971  magnesium transporter  27.6 
 
 		 453 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000190733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4084  magnesium transporter  26.43 
 
 		 470 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1147  magnesium transporter  24.01 
 
 		 479 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3573  magnesium transporter  25.23 
 
 		 473 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>