86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0320 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2375  protein of unknown function DUF208  64.19 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3350  protein of unknown function DUF208  52.49 
 
 		 182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0456  protein of unknown function DUF208  54.75 
 
 		 185 aa  206  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.824375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1629  protein of unknown function DUF208  53.14 
 
 		 183 aa  201  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0790  protein of unknown function DUF208  51.65 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.640403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0545  hypothetical protein  52.57 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1752  protein of unknown function DUF208  50.86 
 
 		 175 aa  190  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00102079  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1180  hypothetical protein  49.14 
 
 		 177 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1651  hypothetical protein  47.7 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000631535  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1611  protein of unknown function DUF208  43.18 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1391  hypothetical protein  48.3 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.134094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1430  hypothetical protein  45.2 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000325673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0890  protein of unknown function DUF208  48.86 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75874e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1663  hypothetical protein  45.21 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3355  protein of unknown function DUF208  48.3 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00113282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1361  hypothetical protein  46.86 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0911427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1116  protein of unknown function DUF208  46.33 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.742928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1081  hypothetical protein  50.29 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0752  hypothetical protein  50.29 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1117  protein of unknown function DUF208  44 
 
 		 174 aa  161  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0183  hypothetical protein  42.2 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0204744  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1349  protein of unknown function DUF208  41.86 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000516644  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0546  protein of unknown function DUF208  39.77 
 
 		 180 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0581  hypothetical protein  34.86 
 
 		 182 aa  128  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.513342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07150  hypothetical protein  36.72 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12630  hypothetical protein  40.11 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0981  protein of unknown function DUF208  38.67 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_546  hypothetical protein  33.91 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0607  hypothetical protein  33.91 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1532  hypothetical protein  35.57 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0879  protein of unknown function DUF208  36.27 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0094  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.658677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1438  hypothetical protein  35.96 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0196  hypothetical protein  35.2 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2092  hypothetical cytosolic protein  37.5 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0198  hypothetical protein  34.08 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1466  hypothetical protein  37.29 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1232  hypothetical protein  33.71 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1393  hypothetical protein  37.29 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1595  hypothetical protein  35.39 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2929  protein of unknown function DUF208  35.05 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0243  hypothetical protein  35.05 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.494674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0182  hypothetical protein  38.64 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2889  hypothetical protein  34.83 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2217  protein of unknown function DUF208  34.62 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674012  normal  0.357063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2588  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2683  hypothetical protein  34.2 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0711386  hitchhiker  0.0011844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3662  hypothetical protein  33.71 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3644  protein of unknown function DUF208  29.05 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0109034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1972  protein of unknown function DUF208  31.79 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03760  hypothetical protein  32.63 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0481  hypothetical protein  28.65 
 
 		 180 aa  99.4  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7371  hypothetical protein  32.62 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2796  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2649  protein of unknown function DUF208  35.71 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2665  hypothetical protein  32.79 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1020  protein of unknown function DUF208  28.88 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1393  protein of unknown function DUF208  30.34 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000049493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0215  protein of unknown function DUF208  33.52 
 
 		 228 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0579  protein of unknown function DUF208  30.16 
 
 		 404 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000161859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2989  hypothetical protein  31.55 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2670  hypothetical protein  31.55 
 
 		 222 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1602  protein of unknown function DUF208  32.76 
 
 		 405 aa  93.2  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1314  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.62773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1128  protein of unknown function DUF208  32.95 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.739523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1223  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  92  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.98372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1085  hypothetical protein  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3509  hypothetical protein  32.09 
 
 		 206 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207175  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2147  hypothetical protein  28.02 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.743435  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2121  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.164612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2121  putative orphan protein  28.41 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0379322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2667  hypothetical protein  24.31 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.723801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2613  hypothetical protein  24.31 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1502  hypothetical protein  26.78 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000385853  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1461  hypothetical protein  27.43 
 
 		 360 aa  82  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0313  hypothetical protein  28 
 
 		 355 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0321  hypothetical protein  29.94 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1356  hypothetical protein  29.71 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1698  hypothetical protein  29.94 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0299  hypothetical protein  29.94 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1401  conserved hypothetical protein (DUF208 domain protein)  27.53 
 
 		 357 aa  78.2  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0862  DNA polymerase III gamma and tau subunits  29.14 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2452  protein of unknown function DUF208  26.7 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0183  protein of unknown function DUF208  27.27 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000889655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  26.5 
 
 		 301 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>