85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2588 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2217  protein of unknown function DUF208  100 
 
 		 233 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674012  normal  0.357063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2588  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  490  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03760  hypothetical protein  69.52 
 
 		 221 aa  332  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7371  hypothetical protein  69.38 
 
 		 223 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2989  hypothetical protein  69.86 
 
 		 222 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2670  hypothetical protein  69.86 
 
 		 222 aa  329  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3662  hypothetical protein  68.9 
 
 		 222 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2889  hypothetical protein  67.76 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2092  hypothetical cytosolic protein  66.82 
 
 		 267 aa  323  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0094  hypothetical protein  66.82 
 
 		 259 aa  323  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.658677  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1393  hypothetical protein  66.08 
 
 		 236 aa  322  2e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1466  hypothetical protein  66.82 
 
 		 248 aa  320  9.000000000000001e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1532  hypothetical protein  66.35 
 
 		 223 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0215  protein of unknown function DUF208  63.43 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1438  hypothetical protein  65.55 
 
 		 221 aa  313  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1595  hypothetical protein  65.55 
 
 		 221 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0243  hypothetical protein  66.51 
 
 		 243 aa  307  9e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.494674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2665  hypothetical protein  62.62 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2796  hypothetical protein  62.62 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2929  protein of unknown function DUF208  64.35 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2683  hypothetical protein  62.67 
 
 		 226 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0711386  hitchhiker  0.0011844 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1972  protein of unknown function DUF208  59.81 
 
 		 216 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3509  hypothetical protein  63.5 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207175  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0182  hypothetical protein  55.61 
 
 		 222 aa  245  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2649  protein of unknown function DUF208  53.68 
 
 		 198 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0481  hypothetical protein  44.57 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0579  protein of unknown function DUF208  40.34 
 
 		 404 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000161859  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1602  protein of unknown function DUF208  40.57 
 
 		 405 aa  142  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0321  hypothetical protein  36.07 
 
 		 363 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1698  hypothetical protein  36.07 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0299  hypothetical protein  36.07 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1461  hypothetical protein  36.93 
 
 		 360 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1401  conserved hypothetical protein (DUF208 domain protein)  36.36 
 
 		 357 aa  132  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0313  hypothetical protein  38.46 
 
 		 355 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2121  putative orphan protein  37.85 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0379322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0862  DNA polymerase III gamma and tau subunits  39.04 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1085  hypothetical protein  38.38 
 
 		 183 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0183  protein of unknown function DUF208  38.76 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000889655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3644  protein of unknown function DUF208  32.14 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0109034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1502  hypothetical protein  37.75 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000385853  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1020  protein of unknown function DUF208  35.91 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1223  hypothetical protein  35.26 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.98372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2147  hypothetical protein  35.29 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.743435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0890  protein of unknown function DUF208  38.2 
 
 		 176 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75874e-25 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3350  protein of unknown function DUF208  39.43 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1314  hypothetical protein  36.52 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.62773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3355  protein of unknown function DUF208  37.64 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00113282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2121  hypothetical protein  34.76 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.164612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1651  hypothetical protein  39.33 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000631535  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1629  protein of unknown function DUF208  35.59 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1752  protein of unknown function DUF208  38.73 
 
 		 175 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00102079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0456  protein of unknown function DUF208  36.16 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.824375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1356  hypothetical protein  32.95 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0183  hypothetical protein  36.07 
 
 		 181 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0204744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1663  hypothetical protein  32.96 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2375  protein of unknown function DUF208  33.9 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2452  protein of unknown function DUF208  34.44 
 
 		 180 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1349  protein of unknown function DUF208  33.52 
 
 		 171 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000516644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2667  hypothetical protein  33.7 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.723801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2613  hypothetical protein  33.7 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1391  hypothetical protein  36.11 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.134094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1430  hypothetical protein  35.06 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000325673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0196  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0790  protein of unknown function DUF208  34.65 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.640403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1116  protein of unknown function DUF208  34.62 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.742928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0320  hypothetical protein  34.62 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0198  hypothetical protein  33.9 
 
 		 189 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1611  protein of unknown function DUF208  31.67 
 
 		 182 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1232  hypothetical protein  29.85 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_546  hypothetical protein  32.18 
 
 		 182 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1361  hypothetical protein  32.8 
 
 		 188 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0911427  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1393  protein of unknown function DUF208  28.65 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000049493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  95.5  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1128  protein of unknown function DUF208  34.83 
 
 		 187 aa  95.1  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.739523  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1117  protein of unknown function DUF208  30.29 
 
 		 174 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0581  hypothetical protein  32.76 
 
 		 182 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.513342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0545  hypothetical protein  34.46 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07150  hypothetical protein  31.28 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0752  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1081  hypothetical protein  36.9 
 
 		 180 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0546  protein of unknown function DUF208  32.02 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0981  protein of unknown function DUF208  33.9 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1180  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12630  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0879  protein of unknown function DUF208  28.71 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.351019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>