86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3509 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207175  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3662  hypothetical protein  72.36 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1438  hypothetical protein  69.15 
 
 		 221 aa  310  7.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1595  hypothetical protein  69.15 
 
 		 221 aa  310  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2889  hypothetical protein  69.65 
 
 		 272 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2670  hypothetical protein  71.28 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2989  hypothetical protein  71.28 
 
 		 222 aa  305  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03760  hypothetical protein  68.72 
 
 		 221 aa  301  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1532  hypothetical protein  67.18 
 
 		 223 aa  301  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2929  protein of unknown function DUF208  67.35 
 
 		 223 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0215  protein of unknown function DUF208  66.17 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.53719 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7371  hypothetical protein  67.69 
 
 		 223 aa  295  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2683  hypothetical protein  65.83 
 
 		 226 aa  295  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0711386  hitchhiker  0.0011844 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1393  hypothetical protein  66.67 
 
 		 236 aa  291  5e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1466  hypothetical protein  68.56 
 
 		 248 aa  290  7e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0243  hypothetical protein  65.28 
 
 		 243 aa  287  8e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.494674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2665  hypothetical protein  64 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2796  hypothetical protein  64.5 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2092  hypothetical cytosolic protein  59.71 
 
 		 267 aa  275  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0094  hypothetical protein  59.22 
 
 		 259 aa  273  9e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.658677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1972  protein of unknown function DUF208  60.71 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2588  hypothetical protein  63.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2217  protein of unknown function DUF208  63.5 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674012  normal  0.357063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2649  protein of unknown function DUF208  57.37 
 
 		 198 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0182  hypothetical protein  53.68 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0481  hypothetical protein  44.83 
 
 		 180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0579  protein of unknown function DUF208  39.55 
 
 		 404 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000161859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0313  hypothetical protein  40.34 
 
 		 355 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2121  putative orphan protein  36.36 
 
 		 358 aa  131  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0379322  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0862  DNA polymerase III gamma and tau subunits  37.3 
 
 		 357 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1602  protein of unknown function DUF208  39.11 
 
 		 405 aa  125  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1502  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000385853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3644  protein of unknown function DUF208  36.7 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0109034  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2147  hypothetical protein  36.26 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.743435  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1461  hypothetical protein  35.8 
 
 		 360 aa  122  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1223  hypothetical protein  37.16 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.98372  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1020  protein of unknown function DUF208  35.71 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1085  hypothetical protein  38.15 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0321  hypothetical protein  33.51 
 
 		 363 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1698  hypothetical protein  33.51 
 
 		 363 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0299  hypothetical protein  33.51 
 
 		 363 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1401  conserved hypothetical protein (DUF208 domain protein)  33.52 
 
 		 357 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0183  protein of unknown function DUF208  37.29 
 
 		 362 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000889655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1356  hypothetical protein  36.36 
 
 		 355 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0634043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2121  hypothetical protein  34.55 
 
 		 205 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.164612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.723801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0456  protein of unknown function DUF208  35.8 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.824375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3350  protein of unknown function DUF208  35.23 
 
 		 182 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0183  hypothetical protein  32.04 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0204744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1128  protein of unknown function DUF208  35.79 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.739523  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1314  hypothetical protein  34.86 
 
 		 263 aa  102  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.62773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1752  protein of unknown function DUF208  34.62 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00102079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2375  protein of unknown function DUF208  34.27 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1349  protein of unknown function DUF208  31.82 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000516644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1629  protein of unknown function DUF208  34.07 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1611  protein of unknown function DUF208  31.69 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1361  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0911427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1663  hypothetical protein  29.67 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0890  protein of unknown function DUF208  32.79 
 
 		 176 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75874e-25 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2452  protein of unknown function DUF208  32.02 
 
 		 180 aa  98.2  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0790  protein of unknown function DUF208  33.16 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.640403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1116  protein of unknown function DUF208  34.24 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.742928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3355  protein of unknown function DUF208  32.79 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00113282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1651  hypothetical protein  35.75 
 
 		 180 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000631535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1391  hypothetical protein  34.83 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.134094  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1232  hypothetical protein  32.02 
 
 		 268 aa  94  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0607  hypothetical protein  34.29 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0581  hypothetical protein  34.66 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.513342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1430  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000325673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1393  protein of unknown function DUF208  28.11 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000049493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_546  hypothetical protein  33.14 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1117  protein of unknown function DUF208  30.34 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0850916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07150  hypothetical protein  30.34 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0198  hypothetical protein  31.64 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0546  protein of unknown function DUF208  31.52 
 
 		 180 aa  89.4  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0320  hypothetical protein  32.09 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0196  hypothetical protein  31.07 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0545  hypothetical protein  31.38 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12630  hypothetical protein  33.14 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0981  protein of unknown function DUF208  30.9 
 
 		 245 aa  85.1  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1081  hypothetical protein  34.43 
 
 		 180 aa  84.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0752  hypothetical protein  30.05 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1180  hypothetical protein  27.78 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0879  protein of unknown function DUF208  27.84 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0364  hypothetical protein  46.94 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521429  normal  0.994406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>