85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2375 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2375  protein of unknown function DUF208  100 
 
 
216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0320  hypothetical protein  64.19 
 
 
217 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0456  protein of unknown function DUF208  55.68 
 
 
185 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.824375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3350  protein of unknown function DUF208  54.64 
 
 
182 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1629  protein of unknown function DUF208  52.75 
 
 
183 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0790  protein of unknown function DUF208  50 
 
 
243 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.640403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0545  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1180  hypothetical protein  47.49 
 
 
177 aa  175  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1752  protein of unknown function DUF208  49.17 
 
 
175 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00102079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1430  hypothetical protein  44.94 
 
 
186 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000325673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1651  hypothetical protein  47.49 
 
 
180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000631535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1391  hypothetical protein  46.67 
 
 
179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.134094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0890  protein of unknown function DUF208  47.8 
 
 
176 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75874e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3355  protein of unknown function DUF208  46.7 
 
 
176 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00113282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1611  protein of unknown function DUF208  41.11 
 
 
182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1117  protein of unknown function DUF208  44.94 
 
 
174 aa  165  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1663  hypothetical protein  41.71 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1116  protein of unknown function DUF208  43.82 
 
 
214 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.742928  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1361  hypothetical protein  44.44 
 
 
188 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0911427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1081  hypothetical protein  47.49 
 
 
180 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1349  protein of unknown function DUF208  44.07 
 
 
171 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000516644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0183  hypothetical protein  39.13 
 
 
181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0204744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0752  hypothetical protein  47.49 
 
 
180 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0546  protein of unknown function DUF208  39.01 
 
 
180 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0981  protein of unknown function DUF208  41.3 
 
 
245 aa  131  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.380231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0581  hypothetical protein  35.56 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.513342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07150  hypothetical protein  37.57 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1532  hypothetical protein  35.16 
 
 
223 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12630  hypothetical protein  39.23 
 
 
241 aa  118  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0198  hypothetical protein  36.26 
 
 
189 aa  117  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_546  hypothetical protein  32.78 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2092  hypothetical cytosolic protein  35.8 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.420687  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1466  hypothetical protein  36.11 
 
 
248 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1438  hypothetical protein  35 
 
 
221 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553594  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1393  hypothetical protein  36.11 
 
 
236 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2889  hypothetical protein  36.11 
 
 
272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2929  protein of unknown function DUF208  35.16 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0094  hypothetical protein  35.23 
 
 
259 aa  115  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.658677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1595  hypothetical protein  34.44 
 
 
221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.853635  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0196  hypothetical protein  36.96 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0182  hypothetical protein  39.55 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3662  hypothetical protein  36.11 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0607  hypothetical protein  33.15 
 
 
182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2683  hypothetical protein  34.44 
 
 
226 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0711386  hitchhiker  0.0011844 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7371  hypothetical protein  34.62 
 
 
223 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263162 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1232  hypothetical protein  33.68 
 
 
268 aa  112  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2649  protein of unknown function DUF208  39.56 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2147  hypothetical protein  32.61 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.743435  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0879  protein of unknown function DUF208  39.89 
 
 
206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1972  protein of unknown function DUF208  31.55 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140394  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0243  hypothetical protein  34.44 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.494674  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2217  protein of unknown function DUF208  33.9 
 
 
233 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674012  normal  0.357063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2588  hypothetical protein  33.9 
 
 
233 aa  109  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1020  protein of unknown function DUF208  28.95 
 
 
248 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2667  hypothetical protein  30.96 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.723801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2613  hypothetical protein  30.96 
 
 
240 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2796  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03760  hypothetical protein  35.16 
 
 
221 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2665  hypothetical protein  32.77 
 
 
220 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2670  hypothetical protein  33.71 
 
 
222 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326959  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2989  hypothetical protein  33.71 
 
 
222 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0215  protein of unknown function DUF208  33.71 
 
 
228 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.53719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3644  protein of unknown function DUF208  32.4 
 
 
205 aa  104  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0109034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1502  hypothetical protein  31.52 
 
 
240 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000385853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3509  hypothetical protein  34.27 
 
 
206 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207175  normal  0.0239615 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1085  hypothetical protein  34.64 
 
 
183 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1223  hypothetical protein  29.89 
 
 
255 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.98372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0579  protein of unknown function DUF208  31.84 
 
 
404 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000161859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0481  hypothetical protein  27.96 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0327538  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1393  protein of unknown function DUF208  28.73 
 
 
209 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000049493  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1602  protein of unknown function DUF208  31.11 
 
 
405 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1314  hypothetical protein  30.34 
 
 
263 aa  92  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.62773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1128  protein of unknown function DUF208  32.77 
 
 
187 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.739523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2121  hypothetical protein  30.27 
 
 
205 aa  89  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.164612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0321  hypothetical protein  29.61 
 
 
363 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0299  hypothetical protein  29.61 
 
 
363 aa  81.3  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1698  hypothetical protein  29.61 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1401  conserved hypothetical protein (DUF208 domain protein)  27.78 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1461  hypothetical protein  29.05 
 
 
360 aa  78.6  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0183  protein of unknown function DUF208  28.33 
 
 
362 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000889655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1356  hypothetical protein  28.18 
 
 
355 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0634043  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2121  putative orphan protein  27.12 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0379322  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2452  protein of unknown function DUF208  24.43 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0313  hypothetical protein  25.84 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0862  DNA polymerase III gamma and tau subunits  27 
 
 
357 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>