139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2985 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  61.83 
 
 		 646 aa  782    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  62.18 
 
 		 607 aa  739    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  70.38 
 
 		 680 aa  816    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 771 aa  1536    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  55.08 
 
 		 746 aa  706    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  47.8 
 
 		 603 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 		 607 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  38.16 
 
 		 781 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  38.16 
 
 		 781 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 605 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  39.26 
 
 		 786 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  38.16 
 
 		 781 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  41.72 
 
 		 773 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  41.53 
 
 		 774 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  40.62 
 
 		 766 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  43.18 
 
 		 625 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  41.24 
 
 		 806 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  40.68 
 
 		 766 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 766 aa  486  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  41.34 
 
 		 745 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  41.34 
 
 		 745 aa  485  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  37.07 
 
 		 791 aa  485  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  42.05 
 
 		 780 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  38.66 
 
 		 790 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  41.01 
 
 		 747 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  38.15 
 
 		 819 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  42.55 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  37.05 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  41.56 
 
 		 807 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  40.76 
 
 		 785 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  40.65 
 
 		 747 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  41.56 
 
 		 812 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  41.56 
 
 		 816 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  37.85 
 
 		 763 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 		 745 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 755 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  37.6 
 
 		 787 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  40.57 
 
 		 736 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  42.99 
 
 		 758 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 		 678 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  41.92 
 
 		 757 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  42.14 
 
 		 740 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  42.93 
 
 		 671 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  42.43 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  38.95 
 
 		 790 aa  479  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  42.43 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 		 599 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  41.6 
 
 		 787 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  42.43 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  41.6 
 
 		 775 aa  477  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  42.43 
 
 		 723 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  40.41 
 
 		 737 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  40.1 
 
 		 763 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  43.96 
 
 		 648 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 770 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2437  radical SAM domain-containing protein  40.72 
 
 		 792 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.491099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  39.72 
 
 		 789 aa  475  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  43.55 
 
 		 688 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  42.03 
 
 		 677 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  42.52 
 
 		 723 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  43.17 
 
 		 679 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  43.55 
 
 		 688 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  40.94 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  46.42 
 
 		 605 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  40.19 
 
 		 724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  42.79 
 
 		 648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0355  hypothetical protein  38.67 
 
 		 812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  36.2 
 
 		 784 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  40.94 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  41.05 
 
 		 739 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  41.05 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  41.05 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4005  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 831 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143433  normal  0.395979 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  41.05 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  41.05 
 
 		 739 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2133  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 810 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  38.01 
 
 		 781 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  42.22 
 
 		 707 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2243  radical SAM domain-containing protein  39.2 
 
 		 847 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  41.03 
 
 		 639 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  40.89 
 
 		 724 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  41.96 
 
 		 674 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1631  Radical SAM domain protein  39.61 
 
 		 829 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.982619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  40.89 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2225  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 795 aa  465  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 752 aa  466  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  39.16 
 
 		 767 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  40.07 
 
 		 622 aa  466  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1897  radical SAM domain-containing protein  38.43 
 
 		 794 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  39.25 
 
 		 769 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  40.25 
 
 		 657 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.67 
 
 		 763 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2734  radical SAM family protein  39.09 
 
 		 798 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.389809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 658 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 771 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3816  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 		 796 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 		 673 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 		 648 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>