143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1897 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  60.5 
 
 		 739 aa  923    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  68.05 
 
 		 766 aa  1091    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  67.39 
 
 		 740 aa  913    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  67.35 
 
 		 710 aa  1003    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  59.42 
 
 		 752 aa  897    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  62.08 
 
 		 786 aa  920    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  67.78 
 
 		 771 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  67.65 
 
 		 769 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0324  hypothetical protein  60.2 
 
 		 815 aa  1004    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.366005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  65.57 
 
 		 740 aa  994    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  64.88 
 
 		 763 aa  991    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  67.83 
 
 		 767 aa  1052    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  924    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  61.53 
 
 		 812 aa  915    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2734  radical SAM family protein  85.71 
 
 		 798 aa  1431    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.389809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  62.62 
 
 		 724 aa  929    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  64.26 
 
 		 745 aa  1019    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  64.26 
 
 		 745 aa  1019    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2995  radical SAM family protein  81.7 
 
 		 831 aa  1403    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221356  normal  0.207788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  59.58 
 
 		 785 aa  895    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  60.75 
 
 		 745 aa  917    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0355  hypothetical protein  60.25 
 
 		 812 aa  1003    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  60 
 
 		 784 aa  920    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  60.82 
 
 		 781 aa  914    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  61.81 
 
 		 781 aa  918    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  61.81 
 
 		 781 aa  918    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  60.03 
 
 		 773 aa  897    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  69.73 
 
 		 747 aa  1110    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  60.56 
 
 		 723 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  67.96 
 
 		 757 aa  1070    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  61.81 
 
 		 781 aa  919    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  66.36 
 
 		 758 aa  1040    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  60 
 
 		 806 aa  899    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  61.23 
 
 		 770 aa  921    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2437  radical SAM domain-containing protein  82.86 
 
 		 792 aa  1383    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.491099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1897  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 794 aa  1649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2243  radical SAM domain-containing protein  76.71 
 
 		 847 aa  1306    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3043  radical SAM domain-containing protein  79.95 
 
 		 408 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3816  radical SAM domain-containing protein  78.07 
 
 		 796 aa  1290    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  60.56 
 
 		 723 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  922    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  61.53 
 
 		 816 aa  915    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  59.72 
 
 		 780 aa  886    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  59.46 
 
 		 724 aa  920    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  61.13 
 
 		 790 aa  905    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  68.9 
 
 		 763 aa  1100    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  61.77 
 
 		 789 aa  927    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  60.42 
 
 		 723 aa  915    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  60.56 
 
 		 723 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  67.92 
 
 		 766 aa  1091    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2008  hypothetical protein  61.12 
 
 		 817 aa  1012    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0530056  normal  0.455739 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  60.44 
 
 		 791 aa  951    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  59.86 
 
 		 755 aa  916    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  69.6 
 
 		 747 aa  1109    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  61.53 
 
 		 819 aa  916    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  59.15 
 
 		 787 aa  927    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2225  Radical SAM domain protein  83.04 
 
 		 795 aa  1386    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  58.5 
 
 		 787 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  923    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  923    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  58.37 
 
 		 774 aa  873    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  60.26 
 
 		 721 aa  931    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  58.39 
 
 		 777 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  60.56 
 
 		 723 aa  917    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  61.53 
 
 		 807 aa  916    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4005  radical SAM domain-containing protein  77.72 
 
 		 831 aa  1323    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143433  normal  0.395979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  67.61 
 
 		 736 aa  1047    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  59.15 
 
 		 775 aa  925    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  923    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  60 
 
 		 790 aa  917    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  60.5 
 
 		 739 aa  924    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  68.55 
 
 		 737 aa  1058    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  57.92 
 
 		 763 aa  865    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2133  radical SAM domain-containing protein  76.57 
 
 		 810 aa  1274    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  62.7 
 
 		 766 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  60.37 
 
 		 739 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1631  Radical SAM domain protein  76 
 
 		 829 aa  1305    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.982619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  63.62 
 
 		 707 aa  623  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  67.05 
 
 		 679 aa  611  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  67.07 
 
 		 674 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  67.55 
 
 		 671 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1984  Radical SAM domain protein  70.54 
 
 		 726 aa  601  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  69.14 
 
 		 679 aa  601  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  66.83 
 
 		 677 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  67.65 
 
 		 678 aa  591  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  66.83 
 
 		 688 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  67.9 
 
 		 688 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  62.95 
 
 		 673 aa  570  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  40.23 
 
 		 657 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  45.43 
 
 		 648 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  45.69 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  45.69 
 
 		 658 aa  364  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  45.18 
 
 		 648 aa  354  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  42 
 
 		 603 aa  336  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 605 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  40.05 
 
 		 598 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  40.45 
 
 		 625 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  41.1 
 
 		 662 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>