140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3187 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  65.06 
 
 		 605 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  62.91 
 
 		 599 aa  777    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  59.62 
 
 		 625 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  65.28 
 
 		 603 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  64.35 
 
 		 598 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  65.69 
 
 		 623 aa  800    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  60.41 
 
 		 605 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 607 aa  1248    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  46.81 
 
 		 639 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  45.85 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  45.85 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  45.85 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  45.85 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  45.85 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  45.07 
 
 		 724 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  46.54 
 
 		 683 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 		 679 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  565  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  47.11 
 
 		 671 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  45.33 
 
 		 622 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  44.5 
 
 		 721 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 		 679 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  45.23 
 
 		 739 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 		 677 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  47.27 
 
 		 678 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  47.95 
 
 		 707 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 		 770 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  47.03 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  46.31 
 
 		 685 aa  552  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  47.44 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  47.44 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 		 688 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  43.87 
 
 		 787 aa  548  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  44.34 
 
 		 781 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  45.55 
 
 		 642 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  44.18 
 
 		 789 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  46.09 
 
 		 621 aa  542  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  43.32 
 
 		 766 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  48.29 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  43.19 
 
 		 791 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  43.32 
 
 		 766 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  43.76 
 
 		 737 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  47.19 
 
 		 612 aa  536  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  43.6 
 
 		 736 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  46.95 
 
 		 673 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  43.37 
 
 		 620 aa  533  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  43.11 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  43.1 
 
 		 747 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  44.1 
 
 		 634 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  43.11 
 
 		 662 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  44.01 
 
 		 710 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  43.85 
 
 		 630 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  43.59 
 
 		 718 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  46.72 
 
 		 614 aa  524  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  45.83 
 
 		 687 aa  519  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  41.98 
 
 		 769 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  41.82 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  43.44 
 
 		 666 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.85 
 
 		 763 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  46.97 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  48.48 
 
 		 607 aa  511  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  46.62 
 
 		 658 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  46.97 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  45.84 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  45.67 
 
 		 648 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  49.73 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  45.47 
 
 		 600 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  41.94 
 
 		 790 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  47.18 
 
 		 646 aa  502  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 589 aa  501  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  42.02 
 
 		 747 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  45.67 
 
 		 648 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  41.26 
 
 		 757 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  44.82 
 
 		 571 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 		 568 aa  495  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.76 
 
 		 620 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  40.88 
 
 		 787 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  40.88 
 
 		 775 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  44.11 
 
 		 583 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  43.98 
 
 		 746 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  42.68 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  40.09 
 
 		 780 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 		 595 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  42.26 
 
 		 657 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 745 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  42.16 
 
 		 807 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  42.16 
 
 		 812 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  42.16 
 
 		 816 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  42.16 
 
 		 819 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  41.67 
 
 		 774 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  41.91 
 
 		 786 aa  317  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  41.67 
 
 		 781 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  41.91 
 
 		 790 aa  316  8e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>