140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0556 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  69.4 
 
 		 605 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  60.79 
 
 		 625 aa  749    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  67.84 
 
 		 603 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  66.72 
 
 		 599 aa  823    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 623 aa  1274    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  67.41 
 
 		 598 aa  830    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  65.78 
 
 		 605 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  65.69 
 
 		 607 aa  800    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  48.16 
 
 		 639 aa  611  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  45.99 
 
 		 679 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  47.22 
 
 		 674 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  45.61 
 
 		 677 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  47.6 
 
 		 671 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  45.23 
 
 		 790 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  43.93 
 
 		 787 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  43.91 
 
 		 683 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 		 679 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  45.97 
 
 		 642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  45.37 
 
 		 707 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  45.75 
 
 		 688 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  46.51 
 
 		 688 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  45.29 
 
 		 678 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  44.65 
 
 		 787 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  44.65 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  44.65 
 
 		 775 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  45.73 
 
 		 622 aa  568  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  43.06 
 
 		 662 aa  568  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  44.53 
 
 		 724 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  45.28 
 
 		 781 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  42.59 
 
 		 662 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  48.5 
 
 		 673 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  45.68 
 
 		 657 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  43.63 
 
 		 763 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  47.34 
 
 		 621 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  44.6 
 
 		 620 aa  553  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  41.87 
 
 		 766 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  44.55 
 
 		 758 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  43.23 
 
 		 770 aa  551  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  42.02 
 
 		 766 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  41.74 
 
 		 685 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  42.86 
 
 		 710 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  41.64 
 
 		 740 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  48.81 
 
 		 598 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  42.02 
 
 		 736 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  42.02 
 
 		 737 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0697261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  43.75 
 
 		 739 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  40.7 
 
 		 769 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  44.06 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  44.06 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  44.06 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  44.06 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  43.75 
 
 		 739 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  44.06 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  43.44 
 
 		 739 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.73 
 
 		 763 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  46.85 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  43.28 
 
 		 739 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 771 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  42.44 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  41.28 
 
 		 745 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  41.28 
 
 		 745 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 		 666 aa  526  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  42.57 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  46.74 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  40.37 
 
 		 784 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  45.44 
 
 		 567 aa  518  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  47.21 
 
 		 658 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  45.44 
 
 		 567 aa  518  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  39.87 
 
 		 630 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  42.72 
 
 		 634 aa  508  1e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  48.04 
 
 		 607 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 		 612 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  46.36 
 
 		 648 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  46.36 
 
 		 648 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  49.03 
 
 		 680 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  41.96 
 
 		 589 aa  507  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  45.77 
 
 		 614 aa  503  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  46.53 
 
 		 648 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 		 568 aa  496  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  42.91 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  45.34 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  45.44 
 
 		 620 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  42.5 
 
 		 583 aa  485  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  43.74 
 
 		 740 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  43.96 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  43.74 
 
 		 746 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 595 aa  431  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  42.31 
 
 		 789 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  44.56 
 
 		 819 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  44.56 
 
 		 812 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  44.56 
 
 		 816 aa  340  7e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  44.56 
 
 		 807 aa  339  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  44.03 
 
 		 781 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  43.24 
 
 		 774 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  44.3 
 
 		 786 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>