139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1409 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  100 
 
 
614 aa  1248    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  49.13 
 
 
639 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  49.24 
 
 
642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  48.51 
 
 
685 aa  598  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  48.84 
 
 
683 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  50.58 
 
 
598 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  49.12 
 
 
640 aa  590  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  49 
 
 
621 aa  590  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  48.95 
 
 
666 aa  577  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  45.28 
 
 
662 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  44.96 
 
 
662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  46.24 
 
 
622 aa  570  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 
600 aa  569  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  47.38 
 
 
718 aa  568  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  46.3 
 
 
620 aa  566  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  49.22 
 
 
603 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  48.19 
 
 
625 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  46.49 
 
 
620 aa  535  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  47.58 
 
 
599 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  46.23 
 
 
605 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
607 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  49.4 
 
 
605 aa  522  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  44.93 
 
 
612 aa  523  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  46.88 
 
 
598 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  43.34 
 
 
671 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  43.49 
 
 
674 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  43.43 
 
 
677 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  43.76 
 
 
679 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  43.54 
 
 
707 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  44.53 
 
 
623 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 
679 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 
688 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.01 
 
 
688 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  43.32 
 
 
678 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 
567 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 
567 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  44.36 
 
 
673 aa  483  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
648 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  44.24 
 
 
648 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.91 
 
 
763 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  38.57 
 
 
812 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 
589 aa  473  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  38.57 
 
 
816 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  38.57 
 
 
819 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  38.57 
 
 
807 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 
648 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  41.02 
 
 
710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 
658 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  38.43 
 
 
787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  38.43 
 
 
775 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  38.11 
 
 
781 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  38.11 
 
 
781 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  37.9 
 
 
773 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  38.11 
 
 
781 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  37.35 
 
 
787 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 
571 aa  462  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  37.5 
 
 
780 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1417  Fe-S oxidoreductase, radical SAM domain protein  41.4 
 
 
583 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  37.71 
 
 
789 aa  465  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  36.22 
 
 
763 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  37.8 
 
 
786 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  37.5 
 
 
777 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  38.36 
 
 
767 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  37.33 
 
 
774 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  38.05 
 
 
766 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_002950  PG0934  hypothetical protein  41.77 
 
 
634 aa  453  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.157188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  36.86 
 
 
785 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 
770 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  38.01 
 
 
757 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  37.43 
 
 
766 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  36.83 
 
 
781 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  38.28 
 
 
736 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  37.97 
 
 
737 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  37.5 
 
 
721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  36.73 
 
 
791 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  36.92 
 
 
790 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  38.1 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  38.1 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
607 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  38.1 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  38.1 
 
 
723 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1506  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
554 aa  438  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  39.4 
 
 
687 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  36.03 
 
 
755 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.05 
 
 
646 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1403  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 
630 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.59751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1188  Radical SAM domain protein  41.22 
 
 
740 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0407  radical SAM domain-containing protein  41.82 
 
 
595 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  43.12 
 
 
680 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  35.89 
 
 
758 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 
746 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  44.87 
 
 
657 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  40.77 
 
 
740 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  39.42 
 
 
747 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  40.21 
 
 
745 aa  306  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  40.21 
 
 
745 aa  306  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  38.94 
 
 
747 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  41.65 
 
 
766 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2225  Radical SAM domain protein  38.24 
 
 
795 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.291322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>