147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1776 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0945  hypothetical protein  59.63 
 
 
657 aa  825    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  100 
 
 
622 aa  1304    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1538  radical SAM domain-containing protein  56.5 
 
 
598 aa  687    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.415289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  52.54 
 
 
612 aa  636    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  51.49 
 
 
639 aa  643    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1858  radical SAM domain-containing protein  56.64 
 
 
600 aa  737    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  54.56 
 
 
621 aa  685    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2444  radical SAM domain-containing protein  56.19 
 
 
640 aa  709    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  51.5 
 
 
642 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  47.84 
 
 
683 aa  624  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  48.94 
 
 
662 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  48.61 
 
 
662 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11120  Fe-S oxidoreductase  48.37 
 
 
718 aa  610  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390145  normal  0.0549005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  49.5 
 
 
685 aa  606  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  47.95 
 
 
603 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  47.65 
 
 
598 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2297  Elongator protein 3/MiaB/NifB  51.09 
 
 
620 aa  597  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  46.73 
 
 
599 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  47.7 
 
 
620 aa  597  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  49.32 
 
 
605 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  47.7 
 
 
666 aa  575  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  44.73 
 
 
625 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  45.73 
 
 
623 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  46.53 
 
 
589 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1409  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 
614 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  46.86 
 
 
605 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  45.33 
 
 
607 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 
679 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  41.24 
 
 
786 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  40.95 
 
 
781 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  40.95 
 
 
781 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  40.95 
 
 
781 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 
678 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.23 
 
 
688 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  43.58 
 
 
679 aa  542  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 
688 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 
677 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  43.09 
 
 
671 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  40.8 
 
 
812 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  40.78 
 
 
790 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  40.8 
 
 
819 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  40.8 
 
 
807 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 
673 aa  538  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  40.8 
 
 
816 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  40.98 
 
 
780 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  41.72 
 
 
674 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  41.34 
 
 
774 aa  537  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  41.45 
 
 
787 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  41.28 
 
 
777 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  41.45 
 
 
775 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  40.83 
 
 
747 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0652  hypothetical protein  40.83 
 
 
763 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  40.67 
 
 
766 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  40.83 
 
 
747 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  40.6 
 
 
763 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  40.52 
 
 
766 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  44.01 
 
 
648 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  40.57 
 
 
806 aa  528  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  40.37 
 
 
757 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  40.52 
 
 
721 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0939  radical SAM family protein  39.61 
 
 
745 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.342945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1083  radical SAM family protein  39.61 
 
 
745 aa  522  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 
745 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  40.21 
 
 
785 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  40.27 
 
 
773 aa  525  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 
648 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 
567 aa  525  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 
567 aa  525  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4663  hypothetical protein  40.65 
 
 
737 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  39.94 
 
 
710 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  39.64 
 
 
740 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 
758 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  46.79 
 
 
568 aa  518  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  40.5 
 
 
736 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0672097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 
770 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  40.09 
 
 
791 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  40.52 
 
 
723 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  39.91 
 
 
739 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0540  hypothetical protein  40.21 
 
 
767 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212733  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2898  radical SAM family protein  40.12 
 
 
724 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  43.31 
 
 
648 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  39.91 
 
 
724 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  38.33 
 
 
755 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4928  radical SAM domain protein  40.67 
 
 
771 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  40.67 
 
 
769 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  41.17 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  40.06 
 
 
784 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  42.41 
 
 
658 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>