150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0819 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2985  Radical SAM domain protein  65.72 
 
 		 771 aa  838    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1359  Elongator protein 3/MiaB/NifB  64.27 
 
 		 646 aa  781    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2121  Radical SAM domain protein  56.41 
 
 		 746 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0819  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 680 aa  1381    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1013  Radical SAM domain protein  63.06 
 
 		 607 aa  749    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000409081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0609  radical SAM family protein  50.53 
 
 		 603 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00147953  hitchhiker  0.00191958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0556  radical SAM domain-containing protein  49.2 
 
 		 623 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.837617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3187  Radical SAM domain protein  49.73 
 
 		 607 aa  529  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00436822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1897  Fe-S oxidoreductase  48.7 
 
 		 625 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000117655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1052  radical SAM domain-containing protein  48.06 
 
 		 605 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.173598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0915  Radical SAM domain protein  47.54 
 
 		 599 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3346  Radical SAM domain protein  48.06 
 
 		 598 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0576598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2873  radical SAM domain-containing protein  49.56 
 
 		 605 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1094  hypothetical protein  45.23 
 
 		 639 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0145194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3349  hypothetical protein  41.76 
 
 		 806 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0066  radical SAM family protein  44.75 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3439  hypothetical protein  40.4 
 
 		 785 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0396  hypothetical protein  41.24 
 
 		 773 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0582  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0068  radical SAM domain-containing protein  45.35 
 
 		 658 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.514908  normal  0.0285773 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  40.78 
 
 		 777 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0596  radical SAM domain-containing protein  43.67 
 
 		 567 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.578273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3126  hypothetical protein  44.21 
 
 		 642 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0311249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0311  hypothetical protein  40.93 
 
 		 786 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0072  Radical SAM domain protein  45.36 
 
 		 648 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.290916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3670  hypothetical protein  37.34 
 
 		 781 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0275  hypothetical protein  37.34 
 
 		 781 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3874  hypothetical protein  37.34 
 
 		 781 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0959799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01783  hypothetical protein  36.98 
 
 		 791 aa  479  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4090  hypothetical protein  41.82 
 
 		 816 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  40.83 
 
 		 780 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3682  hypothetical protein  38.2 
 
 		 790 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3981  hypothetical protein  41.82 
 
 		 812 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4059  hypothetical protein  41.82 
 
 		 819 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6215  radical SAM domain-containing protein  44.64 
 
 		 679 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.310596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4177  hypothetical protein  41.82 
 
 		 807 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0689  radical SAM family protein  43.39 
 
 		 671 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0746  Radical SAM domain protein  43.55 
 
 		 677 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0382  hypothetical protein  36.64 
 
 		 763 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4234  hypothetical protein  41.85 
 
 		 721 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.577109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1996  radical SAM family protein  41.88 
 
 		 740 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1663  Radical SAM domain protein  41.26 
 
 		 745 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4193  Radical SAM domain protein  43.72 
 
 		 678 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0084  Radical SAM domain protein  45.53 
 
 		 648 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.028481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1776  hypothetical protein  41.84 
 
 		 622 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0585  hypothetical protein  41.4 
 
 		 787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0942  radical SAM domain-containing protein  43.75 
 
 		 679 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4218  hypothetical protein  41.07 
 
 		 774 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6414  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 		 766 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0666  hypothetical protein  41.4 
 
 		 775 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0603  hypothetical protein  40.55 
 
 		 683 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65080  hypothetical protein  39.07 
 
 		 747 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0281  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 589 aa  467  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1314  hypothetical protein  40.68 
 
 		 789 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7218  hypothetical protein  43.28 
 
 		 674 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3616  hypothetical protein  37.66 
 
 		 685 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4610  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 688 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5075  Radical SAM domain protein  44.11 
 
 		 688 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.369209 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2271  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 770 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3424  hypothetical protein  40.61 
 
 		 724 aa  463  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0684  Radical SAM domain protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1515  Radical SAM domain protein  40.26 
 
 		 758 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0572332  hitchhiker  0.00245581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003066  hypothetical protein  38.15 
 
 		 781 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3424  hypothetical protein  41.83 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2003  radical SAM family protein  42.68 
 
 		 707 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3519  hypothetical protein  41.83 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3352  hypothetical protein  41.83 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0856  hypothetical protein  35.36 
 
 		 790 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.109884  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3349  hypothetical protein  41.83 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1103  radical SAM domain-containing protein  46.1 
 
 		 673 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.204136  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4750  hypothetical protein  35.37 
 
 		 766 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000182579 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3451  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3418  hypothetical protein  41.83 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02777  hypothetical protein  39.77 
 
 		 787 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3194  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3484  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0681  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3300  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0672097 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02888  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4872  hypothetical protein  35.42 
 
 		 766 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.783093  normal  0.109803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07700  hypothetical protein  41.68 
 
 		 757 aa  459  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.568115  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3431  radical SAM-like  40.33 
 
 		 784 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1364  radical SAM domain-containing protein  39.87 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5654  hypothetical protein  37.88 
 
 		 747 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02838  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4327  hypothetical protein  41.21 
 
 		 739 aa  459  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0293  hypothetical protein  41.89 
 
 		 710 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3203  radical SAM domain-containing protein  39.01 
 
 		 752 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.939016  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1109  Radical SAM domain protein  40.7 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.890323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2132  hypothetical protein  40.95 
 
 		 620 aa  452  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1972  Radical SAM domain protein  44.46 
 
 		 621 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.270598  normal  0.360161 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1407  hypothetical protein  36.19 
 
 		 662 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00374356  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1216  hypothetical protein  36.04 
 
 		 662 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.364904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4160  hypothetical protein  41.58 
 
 		 687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0262  radical SAM domain-containing protein  41.7 
 
 		 568 aa  449  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.282617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2153  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.03 
 
 		 763 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4928  hypothetical protein  35.17 
 
 		 736 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0587  hypothetical protein  37.34 
 
 		 769 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282021  normal  0.175321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2328  Radical SAM domain protein  38.58 
 
 		 666 aa  442  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.80431 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1632  extracellular solute-binding protein  41.34 
 
 		 612 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>