130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3513 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
81 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  48.28 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  55.42 
 
 
102 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  48.24 
 
 
93 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  51.81 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  45.98 
 
 
95 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  47.73 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  53.01 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  52.5 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  48.19 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  45.78 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  53.85 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  46.99 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  47.06 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  43.75 
 
 
85 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  44.44 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  45.16 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  38.57 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  33.73 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  32.5 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  39.13 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  39.06 
 
 
90 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  41.27 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  36.51 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  42.86 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  34.92 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  42.86 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  40.35 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  40.35 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  37.14 
 
 
89 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  31.25 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  40.62 
 
 
85 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  31.33 
 
 
91 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  41.94 
 
 
91 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  31.76 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  38.6 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  38.6 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  35.14 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
86 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  34.21 
 
 
119 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  35 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  38.33 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  38.1 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  36.71 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  39.29 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  36.36 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  36.71 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  36.51 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  34.92 
 
 
90 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  33.87 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  36.9 
 
 
92 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  41.51 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  30.12 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  28.57 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  38.98 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  39.68 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  31.82 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  32.31 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  36.67 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  39.62 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  35.82 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  33.8 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  27.85 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  35.71 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  26.51 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  35.48 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  38.6 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  32.14 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  38.18 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  37.74 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  34.29 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  30.65 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  31.65 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  45.45 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  32.1 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  38.18 
 
 
122 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  31.82 
 
 
91 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>