230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1007 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
100 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  82 
 
 
100 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  46.48 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  44.58 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  46.48 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  44.58 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  46.91 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  44.58 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  45.57 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  44.58 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  46.25 
 
 
91 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  40.96 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  43.04 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  41.43 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  43.66 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  39.56 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  38.38 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  46.97 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  43.06 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  39.56 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  46.97 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  41.05 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  40.51 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  39.58 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  39.58 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  40.22 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  41.25 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  39.02 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  46.97 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  46.97 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  42.5 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  43.3 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  41.46 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  45 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  37.97 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  38 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  37.36 
 
 
95 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  42.42 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  38.75 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  41.43 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  39.56 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  36.26 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  39.56 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  43.37 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  31.43 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  45.31 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  45.31 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  39.76 
 
 
100 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  39.56 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  43.75 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  38.54 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  35.63 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  36.73 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  35.05 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  36.73 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  38.75 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  32.56 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  37.08 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  39.02 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  34 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  36.67 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  39.36 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  44.83 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  35.11 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  36.73 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  48.21 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  38.96 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  30.23 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  40.58 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  41.1 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  36.08 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  44.83 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  58 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>