More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1900 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
109 aa  222  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  70.75 
 
 
110 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  72.12 
 
 
103 aa  146  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  71.72 
 
 
101 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  64.15 
 
 
119 aa  140  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  70.19 
 
 
100 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  62.73 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  67.33 
 
 
101 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  63.81 
 
 
119 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  71.28 
 
 
108 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  73.12 
 
 
98 aa  133  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  69.57 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  79.01 
 
 
126 aa  130  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  70.97 
 
 
93 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  62.96 
 
 
109 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  62.96 
 
 
109 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  69.89 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  68.82 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  68.48 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  63.46 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  73.12 
 
 
98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  71.74 
 
 
93 aa  128  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  68.09 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  68.82 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  65.96 
 
 
109 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  67.39 
 
 
93 aa  127  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  65.96 
 
 
109 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  68.48 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  60.19 
 
 
125 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  67.74 
 
 
93 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  62.77 
 
 
145 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  64.52 
 
 
93 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  63.64 
 
 
109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  64.21 
 
 
95 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0918  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
103 aa  118  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  64.52 
 
 
109 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  62.11 
 
 
96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  57.55 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  66.67 
 
 
97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  59.14 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  59.14 
 
 
103 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  59.57 
 
 
103 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  61.7 
 
 
98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  66.3 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  58.06 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  59.38 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  59.78 
 
 
93 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  62.96 
 
 
93 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  58.62 
 
 
93 aa  101  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
97 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
99 aa  94.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  55.81 
 
 
91 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  53.66 
 
 
103 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  49.5 
 
 
126 aa  92  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  44.32 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  45.63 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  43.01 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  53.66 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  53.66 
 
 
103 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  51.22 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  51.22 
 
 
103 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  56.79 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  88.6  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  47.42 
 
 
98 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  55.56 
 
 
91 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  52.27 
 
 
86 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  42.05 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  56.72 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  54.32 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  50.62 
 
 
91 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  56.72 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  47.73 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  53.09 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  53.09 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  56.92 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1211  hypothetical protein  55.91 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  53.09 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  53.73 
 
 
121 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3786  hypothetical protein  55.43 
 
 
103 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  50.62 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  53.09 
 
 
91 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  49.43 
 
 
95 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  47.67 
 
 
98 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  47.06 
 
 
91 aa  80.1  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  49.35 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  40.45 
 
 
92 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  44.32 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>