More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10580 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  200  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  71.72 
 
 
109 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  72.04 
 
 
109 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  72.04 
 
 
109 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  66.32 
 
 
119 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  67.35 
 
 
103 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  70.65 
 
 
109 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  70.65 
 
 
109 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  70 
 
 
101 aa  131  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  69.89 
 
 
100 aa  130  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  66.3 
 
 
108 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  65 
 
 
109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  68.48 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  67.39 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  71.43 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  67.03 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  63.46 
 
 
125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  67.39 
 
 
93 aa  124  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0918  protein of unknown function DUF156  61.46 
 
 
103 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  66.3 
 
 
103 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  64.58 
 
 
110 aa  124  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  66.3 
 
 
103 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  65.22 
 
 
103 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  63.74 
 
 
93 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  65.22 
 
 
93 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  65.22 
 
 
96 aa  120  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  61 
 
 
152 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  61.96 
 
 
93 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  61.7 
 
 
98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  55.56 
 
 
119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  61.86 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  69.89 
 
 
109 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  64.84 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  68.82 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  65.93 
 
 
93 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  64.13 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  61.54 
 
 
93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  61.54 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  61.54 
 
 
97 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  60.44 
 
 
93 aa  113  8.999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  64.29 
 
 
104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  56.52 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  61.54 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  69.23 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  61.96 
 
 
93 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  58.7 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  64.84 
 
 
141 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  61.54 
 
 
93 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  59.78 
 
 
98 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  59.3 
 
 
93 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  60.47 
 
 
93 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  53.33 
 
 
99 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  46 
 
 
103 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  49.45 
 
 
100 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  50.57 
 
 
92 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  48.89 
 
 
97 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1211  hypothetical protein  56.52 
 
 
93 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  47.83 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  49.41 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  49.41 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  49.41 
 
 
121 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  52.75 
 
 
126 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  39.81 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
99 aa  83.2  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3786  hypothetical protein  56.04 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  48.24 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  42.11 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  53.01 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  49.41 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  47.31 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  37.25 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  38.24 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  41.46 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  46.99 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  41.46 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  50.75 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  50.75 
 
 
103 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  54.41 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  40.21 
 
 
97 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  43.48 
 
 
101 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  50.72 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0892  hypothetical protein  40.91 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.86741e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  52.38 
 
 
97 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  44.71 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  44.83 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  39.78 
 
 
96 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  48.15 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  41.3 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  43.21 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>