247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2574 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  93.18 
 
 
88 aa  166  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  70.11 
 
 
87 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  65.52 
 
 
85 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  63.22 
 
 
85 aa  115  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  64.37 
 
 
85 aa  114  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  60 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  61.9 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  61.9 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  61.9 
 
 
89 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  59.52 
 
 
89 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  61.9 
 
 
89 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  59.52 
 
 
89 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  59.52 
 
 
89 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  57.14 
 
 
89 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  57.14 
 
 
89 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  57.14 
 
 
89 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  60.24 
 
 
85 aa  103  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  61.36 
 
 
90 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  54.76 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  54.12 
 
 
90 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  52.81 
 
 
91 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  45.54 
 
 
102 aa  94  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  43.68 
 
 
86 aa  92  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  51.19 
 
 
97 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  50.59 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  43.82 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  51.28 
 
 
87 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  42.7 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  51.28 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  41.84 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  47.44 
 
 
89 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  46.25 
 
 
91 aa  78.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  55 
 
 
87 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  40.74 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  54.55 
 
 
87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  40.48 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  46.03 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  52.73 
 
 
87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  50.91 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  47.46 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  44.93 
 
 
91 aa  60.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  40.85 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  40.3 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  34.18 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  34.18 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  46.43 
 
 
86 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  42.65 
 
 
92 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  34.29 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  43.64 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  43.64 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  43.64 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  44.07 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
91 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  44.62 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
89 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  44.64 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  40.54 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1747  protein of unknown function DUF156  42.65 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00210309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  43.9 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  43.64 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  42.19 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  43.08 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  35.62 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  36.99 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  46.15 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  34.38 
 
 
102 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  37.88 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  35.8 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  37.93 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  34.67 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  40.98 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  34.67 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  32.91 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  32.91 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  40.74 
 
 
94 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  34.85 
 
 
88 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  38.98 
 
 
91 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  35.62 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  45.45 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  30.86 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>