178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1705 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
87 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  78.16 
 
 
91 aa  144  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  77.01 
 
 
89 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  73.56 
 
 
89 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  77.11 
 
 
83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  73.56 
 
 
87 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  70.11 
 
 
89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  64.37 
 
 
87 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  65.56 
 
 
89 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  65.56 
 
 
89 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  65.56 
 
 
89 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  63.29 
 
 
90 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  61.8 
 
 
89 aa  102  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  63.33 
 
 
89 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  64.44 
 
 
104 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  58.43 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  60.67 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  59.55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  59.55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  59.55 
 
 
89 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  55.68 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  54.02 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  55.17 
 
 
85 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  49.43 
 
 
90 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  51.72 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  50.57 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  47.13 
 
 
88 aa  84.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  45.45 
 
 
102 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  54.43 
 
 
86 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  52.56 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  47.73 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  53.16 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  44 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  44 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  44.59 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  39.74 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  50.98 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  43.24 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  47.27 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  38.75 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  36.14 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  48.39 
 
 
120 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  39.34 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  37.29 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
88 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  37.29 
 
 
103 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  44.23 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  39.29 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  43.64 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  41.82 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  44.44 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  41.51 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  41.51 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  34.94 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  39.34 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  36.92 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  40.58 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  31.33 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  31.34 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  40 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  41.51 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  36.84 
 
 
76 aa  48.1  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  34.67 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  39.29 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  42.59 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  30.86 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  37.74 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  33.77 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  40.58 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  36.51 
 
 
86 aa  47  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  41.18 
 
 
96 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  33.77 
 
 
121 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  35.06 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  39.62 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  35.06 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  29.73 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  33.96 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  33.96 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>