24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1453 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  100 
 
 		 63 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  49.21 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  49.21 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  53.97 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  51.56 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  49.21 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  50.79 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  49.21 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  49.21 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  47.62 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  49.21 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  49.21 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  46.03 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  49.21 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  46.03 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  43.08 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  41.27 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  43.75 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  55.26 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  41.27 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  47.37 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>