186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1887 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  77.17 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  55.91 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  58.62 
 
 		 88 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  50.54 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  58.62 
 
 		 91 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  55.06 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  52.69 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  54.44 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  50.56 
 
 		 95 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  53.33 
 
 		 91 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  52.17 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  51.69 
 
 		 97 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  55.17 
 
 		 88 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  56.96 
 
 		 96 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  52.69 
 
 		 85 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  50.57 
 
 		 89 aa  93.6  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  50.54 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  50.85 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  43.75 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  34.67 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  32.94 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  34.67 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  39.71 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  32.53 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  34.72 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  39.13 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  39.13 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  31.65 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  31.65 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  31.65 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  31.25 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  42.62 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  36.62 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  32 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  39.06 
 
 		 103 aa  50.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  34.18 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  41.94 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  32.94 
 
 		 115 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  33.72 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  29.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  31.15 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  31.11 
 
 		 116 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  30.77 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  31.71 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  35.9 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  32.1 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  34.38 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  34.38 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  30 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  32.5 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  32.5 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  30.38 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  31.71 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  31.94 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  31.94 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  28.75 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  31.51 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  29.63 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  27.5 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  32.5 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  31.25 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  30.38 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  31.33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  30.77 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  30.59 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  34.15 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  34.67 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  34.78 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  33.75 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  32.81 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  34.25 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>