223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1146 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
85 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  53.93 
 
 
89 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  54.74 
 
 
92 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  55.43 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  55.68 
 
 
95 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  52.69 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  57.47 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  53.41 
 
 
91 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  55.68 
 
 
97 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  55.43 
 
 
91 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  54.65 
 
 
91 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  49.46 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  54.55 
 
 
102 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  48.86 
 
 
92 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  52.87 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  46.74 
 
 
92 aa  85.1  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  51.14 
 
 
97 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  52.27 
 
 
97 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  52.56 
 
 
96 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  43.75 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  47.62 
 
 
63 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  48.15 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  38.18 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  39.74 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  36.59 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  40.3 
 
 
92 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  36.05 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  37.31 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  38.03 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  42.62 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  34.04 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  36.11 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  35.82 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  49.09 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  37.31 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  31.87 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  41.54 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  32.84 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  38.03 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  37.29 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  39.06 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  36.84 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  34.09 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  55.26 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32.47 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  38.6 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32.47 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  37.88 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  41.07 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  38.98 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  35.94 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  34.85 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  35.71 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  35.82 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  32.86 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  27.71 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  34.48 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  43.1 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  39.06 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  38.18 
 
 
91 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  37.93 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  34.85 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  34.78 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  34.94 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  32.2 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  31.25 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  36.62 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  31.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  38.18 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  39.19 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  31.82 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  38.18 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  30.88 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  40.68 
 
 
90 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  43.4 
 
 
107 aa  47  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  32.35 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  37.31 
 
 
99 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  38.18 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  30.16 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  34.09 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>