219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5165 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  84.95 
 
 
97 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  81.05 
 
 
97 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  76.84 
 
 
97 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  77.78 
 
 
95 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  69.32 
 
 
91 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  69.23 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  60.23 
 
 
92 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  63.64 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  63.95 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  63.33 
 
 
93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  58.89 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  56.18 
 
 
92 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  61.63 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  60.47 
 
 
91 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  56.82 
 
 
89 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  55.06 
 
 
94 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  58.62 
 
 
91 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  54.55 
 
 
85 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  55.42 
 
 
81 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  57.14 
 
 
63 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  36.17 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  33.01 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  50.79 
 
 
63 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  38.61 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  38.61 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  35.92 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  35.16 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  36.84 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  37.11 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  32.95 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  36.92 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  37.33 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  37.33 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  40.62 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  43.86 
 
 
90 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  42.19 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  39.47 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  37.66 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  29.89 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  35.9 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  35.87 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  34.44 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  36.99 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  38.16 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  36.51 
 
 
121 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  31.37 
 
 
127 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  32.1 
 
 
98 aa  53.9  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  36.51 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  34.25 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  39.44 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  33.77 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  35.38 
 
 
121 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  39.13 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  35.38 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  37.7 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  31.52 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  32.95 
 
 
92 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  34.78 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  29.76 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  35.21 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  35.94 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  33.77 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  37.7 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  37.7 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  37.14 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  39.44 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  39.44 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  39.34 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  40.74 
 
 
93 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  34.15 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  32.86 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  43.55 
 
 
109 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  35.14 
 
 
109 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  43.55 
 
 
109 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  41.07 
 
 
85 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  39.44 
 
 
89 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  32.5 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>