246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4727 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  95.45 
 
 
91 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  78.41 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  65.91 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  60.47 
 
 
92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  62.07 
 
 
91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  59.3 
 
 
89 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  61.63 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  55.81 
 
 
92 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  56.98 
 
 
97 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  55.17 
 
 
95 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  58.62 
 
 
94 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  56.98 
 
 
97 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  55.81 
 
 
97 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  58.97 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  54.65 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  51.72 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  57.47 
 
 
85 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  52.5 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  49.21 
 
 
63 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  47.62 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  42.35 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  41.43 
 
 
119 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  46.38 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  45.16 
 
 
87 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  46.77 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  38.75 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  46.77 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  46.15 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  36.25 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  36.25 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  45.16 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  39.73 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  33.72 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  36.25 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  34.15 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  41.27 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  36 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  34.67 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  33.75 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  40.32 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  45.16 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  39.13 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  38.46 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  47.27 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  27.59 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  28.4 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  28.4 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  35.94 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  32.86 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  45.9 
 
 
90 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  30.59 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
89 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  32.5 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  36.92 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  36.92 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  32.5 
 
 
103 aa  52.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3147  hypothetical protein  39.06 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  35.14 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  35.14 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  32 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  34.72 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  47.27 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  31.33 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  45.45 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  45.45 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  32 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  32.35 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  35.53 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  36.76 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  35.21 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  35.21 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  32.84 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  36.84 
 
 
85 aa  52  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  36.92 
 
 
121 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>