235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3757 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  53.68 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  38.55 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  35.42 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  37.35 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  43.9 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  46.27 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  44.16 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  38.64 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  42.5 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  35.16 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  34.94 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  46.67 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  35.05 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  36.59 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  43.55 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  43.55 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  45 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  44.78 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  40.74 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  48.98 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  34.07 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  46.43 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  46.43 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  35.23 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  49.15 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  41.79 
 
 		 93 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  42.03 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  36.84 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  49.02 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  32.94 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  40.58 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  41.33 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  32.53 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  40.74 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  31.82 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  40.32 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  37.33 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  46.77 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  32.53 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  35.44 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  35.44 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  30.11 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  30.11 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  35.14 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  34.88 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  37.88 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  40.91 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  36.14 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  44.64 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1747  protein of unknown function DUF156  52.94 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00210309  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  39.68 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  30.11 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  48.15 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  45.1 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  35.21 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  54.55 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  37.68 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  36.92 
 
 		 91 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  29.76 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  43.86 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  34.94 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  44.64 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  36 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  38.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>