291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3295 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  184  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  91.49 
 
 
94 aa  175  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  53.85 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  43.48 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  46.34 
 
 
90 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  40.96 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  45.57 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  50.79 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  47.76 
 
 
91 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  44.59 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  45.21 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  33.73 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  35.56 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  43.94 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  40.24 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  43.04 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  43.1 
 
 
92 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  43.21 
 
 
102 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  44.62 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  38.89 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  54.17 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  38.27 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  35.37 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  35.56 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  38.96 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  38.96 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  43.42 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  35.56 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2725  protein of unknown function DUF156  36.11 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  43.06 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  45 
 
 
87 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 
86 aa  58.2  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  43.1 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  36.14 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  45.31 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  47.06 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  39.44 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  41.03 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  39.73 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  38.1 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  43.28 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  35.96 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  37.04 
 
 
92 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
121 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  47.69 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  45 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  43.42 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  47.46 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
93 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  45.16 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  45.21 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  38.89 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  43.42 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  26.74 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  42.42 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  46.15 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  43.94 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2404  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 
201 aa  54.7  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  37.8 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  39.24 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  39.06 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  43.55 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  40.74 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  48.44 
 
 
101 aa  54.7  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  37.84 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  37.84 
 
 
126 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  38.14 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1552  protein of unknown function DUF156  39.71 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05294  normal  0.0149164 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  38.14 
 
 
109 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>