239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3746 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  53.68 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  56.86 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  39.76 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  56.82 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  45.16 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  36.25 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  45.16 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  48.15 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  43.08 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  45 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  53.06 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  48.15 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  48.15 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  55.56 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  30.12 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  52.08 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  44.44 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  53.33 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  52.17 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  50.98 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  59.09 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  48 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  40.62 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  51.02 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  54.76 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  37.97 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  56.41 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  37.97 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  37.97 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  46.94 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  38.71 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  51.16 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  62.5 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  41.79 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  52.08 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  36.23 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  53.49 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  45.65 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  41.67 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  44.9 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  52.38 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  42.62 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  38.71 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  48.84 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  40.3 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  42.59 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  59.52 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  47.62 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  49.06 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  52.5 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  52.5 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  46.3 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  60 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  31.76 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  57.5 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  33.72 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  53.66 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  40 
 
 		 89 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  38.33 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  31.91 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  57.14 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  47.06 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  42.59 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  44.68 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  43.33 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  48.98 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  55 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  46.94 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  37.88 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>