197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0834 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
89 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  82.02 
 
 
89 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  82.02 
 
 
89 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  80.9 
 
 
104 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  78.65 
 
 
89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  78.65 
 
 
89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  78.65 
 
 
89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  76.4 
 
 
89 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  76.4 
 
 
89 aa  143  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  76.4 
 
 
89 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  74.16 
 
 
89 aa  140  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  71.11 
 
 
90 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  59.3 
 
 
88 aa  107  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  61.8 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  62.92 
 
 
83 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  60.92 
 
 
90 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  60.47 
 
 
87 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  59.52 
 
 
88 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  63.95 
 
 
85 aa  103  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  63.41 
 
 
85 aa  103  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  64.94 
 
 
91 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  59.3 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  58.33 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  59.74 
 
 
89 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  57.89 
 
 
87 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  59.76 
 
 
85 aa  93.2  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  57.89 
 
 
89 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  55.26 
 
 
89 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  58.44 
 
 
97 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  51.76 
 
 
86 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  51.14 
 
 
91 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  46.07 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  65.15 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  46.75 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  45.76 
 
 
85 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  50.91 
 
 
87 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  51.61 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  49.09 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  49.09 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  43.06 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  45.95 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  33.72 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0837  hypothetical protein  44.12 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0492349  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  39.29 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  39.29 
 
 
126 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  41.51 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  34.15 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  45.28 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  46.77 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  40.28 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  46.77 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  40.98 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  39.06 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  38.81 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  39.06 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  39.06 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  40.68 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3638  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  34.43 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  34.43 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  34.72 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  42.86 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  31.75 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  34.48 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  40.32 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  39.34 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  37.7 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  29.87 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  37.29 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  30.16 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  42.11 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  32.2 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  28.99 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  37.7 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  32.35 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  37.7 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  40.74 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  38.46 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  26.67 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>