More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1898 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  177  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  48.19 
 
 
89 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  46.07 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  45.56 
 
 
91 aa  82  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  46.34 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  48.24 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  46.99 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  52.05 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  39.56 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  41.98 
 
 
81 aa  73.9  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  50.7 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  50.68 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  38.64 
 
 
86 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  39.53 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  40.96 
 
 
101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  50.85 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  41.57 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  39.29 
 
 
108 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  41.57 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  41.67 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  41.67 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  49.3 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  39.08 
 
 
100 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  49.3 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  46.15 
 
 
100 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  46.97 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  37.63 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  41.25 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  41.27 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  40.45 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  43.94 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  33.71 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  38.27 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  43.24 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  35.56 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  47.69 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
107 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  38.37 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
82 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  35.23 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  43.75 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
141 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
92 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  35 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  36.36 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  47.62 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  34.94 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  44.07 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  44.07 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  44.83 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  47.54 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  47.46 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  50.91 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  43.08 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  38.67 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  31.11 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  45.76 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  44.83 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  41.54 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  49.06 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  50.94 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
127 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  50.94 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  36.56 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  40 
 
 
93 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  46.43 
 
 
126 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  39.06 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3786  hypothetical protein  45.21 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  50.94 
 
 
121 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  50.91 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  43.06 
 
 
93 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  44.83 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0017  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  38.75 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  37.84 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  43.1 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  41.54 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2171  protein of unknown function DUF156  36.49 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  41.54 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1838  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  41.54 
 
 
103 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  45.31 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  30 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>