266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3027 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  183  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  76.92 
 
 
102 aa  148  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2871  hypothetical protein  48.78 
 
 
98 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4267  hypothetical protein  48.57 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  48.61 
 
 
91 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  51.85 
 
 
97 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  46.55 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1900  protein of unknown function DUF156  44.05 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  44.29 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  47.54 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  55.93 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3668  hypothetical protein  55.93 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531949  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  55.93 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3702  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  normal  0.0547705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  51.67 
 
 
98 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  48.65 
 
 
95 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  51.61 
 
 
103 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  57.41 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5191  protein of unknown function DUF156  45.83 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0909997  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  52.17 
 
 
93 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  57.41 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  48.39 
 
 
100 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  43.06 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  53.57 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  47.62 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  53.57 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  48.39 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  40.51 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  55.36 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  46.88 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  39.29 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  39.29 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  49.23 
 
 
97 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  40.24 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  41.25 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  44.12 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  47.62 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  53.7 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  42.67 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5881  hypothetical protein  47.46 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3257  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.664348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  46.38 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  49.18 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  46.38 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  46.55 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3671  protein of unknown function DUF156  40.51 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  50.88 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  43.04 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2597  protein of unknown function DUF156  43.21 
 
 
109 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
103 aa  62  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  37.84 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  39.02 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  54.72 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  38.55 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  48.21 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  44.93 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4242  protein of unknown function DUF156  43.21 
 
 
115 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  42.67 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  48.28 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  47.69 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3443  protein of unknown function DUF156  41.94 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0992847  hitchhiker  0.00675708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  47.69 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  47.54 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  42.19 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  40.26 
 
 
91 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  43.28 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  35.9 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  48.28 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3871  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
125 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00362908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  43.84 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  48.28 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  51.92 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  39.71 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  44.07 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  41.67 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  45.9 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  45.9 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2851  hypothetical protein  48.21 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.978833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0673  hypothetical protein  46.88 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121389  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0466  protein of unknown function DUF156  46.67 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686705  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0101  protein of unknown function DUF156  37.68 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  38.98 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  43.84 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  39.71 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4499  hypothetical protein  41.27 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.519747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  42.47 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  40.62 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21350  hypothetical protein  54.72 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.481053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  34.52 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 
103 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  35.06 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  43.94 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>