More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2133 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  69.66 
 
 
97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  61.8 
 
 
96 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  62.92 
 
 
96 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  62.92 
 
 
96 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  63.64 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  44.44 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  45.05 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  47.13 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  47.13 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  37.36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  42.35 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  42.53 
 
 
101 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  46.91 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  40.23 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  43.82 
 
 
103 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  39.08 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  39.08 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  39.08 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  37.08 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  38.89 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  36.17 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  42.05 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  42.05 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  41.25 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  41.25 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  37.8 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1838  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  37.93 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  33.7 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  40 
 
 
91 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1552  protein of unknown function DUF156  38.37 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05294  normal  0.0149164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  31.03 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  34.88 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  36.9 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  40.58 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  39.08 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  36.96 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0101  protein of unknown function DUF156  36 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  32.63 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  38.55 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3404  hypothetical protein  35.87 
 
 
93 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  35.23 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  41.79 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  35.23 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  35.48 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  35.16 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  44.59 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  33.72 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 
87 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  45.16 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9134  hypothetical protein  34.78 
 
 
93 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  35.37 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  39.68 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  32.98 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36760  hypothetical protein  35.29 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  34.07 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  31.25 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  38.1 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  35.8 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  33.7 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  33.7 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  33.7 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  35.23 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  41.94 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  34.52 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  40.91 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  36.78 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  45.9 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  38.03 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  34.57 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  42.03 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  35.8 
 
 
98 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  37.66 
 
 
86 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  40.98 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  39.39 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  40.98 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  32.05 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  33.7 
 
 
145 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  37.31 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  40.32 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5303  hypothetical protein  37.21 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.198456  normal  0.383245 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5706  hypothetical protein  37.21 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.840437 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  39.44 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  34.44 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  30.12 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  37.14 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  30.12 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>