208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0558 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  74.42 
 
 
91 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  65.56 
 
 
97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  65.93 
 
 
102 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  65.12 
 
 
97 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  61.96 
 
 
97 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  59.38 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1769  hypothetical protein  59.77 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0590786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  57.14 
 
 
92 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  62.07 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  61.36 
 
 
93 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1887  hypothetical protein  55.68 
 
 
94 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2756  hypothetical protein  58.14 
 
 
89 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  55.06 
 
 
93 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  54.65 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  55.81 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  55.81 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4224  hypothetical protein  52.22 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.39415  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1583  NreA protein  65.08 
 
 
63 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3513  protein of unknown function DUF156  53.01 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1146  protein of unknown function DUF156  50 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1453  NreA protein  49.21 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0385778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  35.11 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  34.52 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  49.09 
 
 
86 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  43.28 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  49.09 
 
 
85 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  46.3 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4381  hypothetical protein  34.21 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0148  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0157  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.603264  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0138  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  34.85 
 
 
91 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  34.67 
 
 
91 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  42.42 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  35.62 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1007  protein of unknown function DUF156  35.23 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20895  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3817  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  34.67 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  40.98 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2632  hypothetical protein  36 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00527658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36130  hypothetical protein  41.51 
 
 
93 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.225482  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  32.86 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  32.39 
 
 
145 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  43.64 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  47.06 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  35.48 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10191  hypothetical protein  32.35 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  35.62 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  36.67 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  40.98 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  36.07 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  36.07 
 
 
103 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2499  protein of unknown function DUF156  34.92 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  49.02 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  32.1 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0212  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.050462  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  38.6 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4465  hypothetical protein  38.36 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4548  hypothetical protein  38.36 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  32.31 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  32.86 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0988  protein of unknown function DUF156  27.27 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.11096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2284  hypothetical protein  37.5 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4097  hypothetical protein  32.81 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3602  protein of unknown function DUF156  32.1 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.251846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  39.29 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  39.29 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  30.59 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  30.59 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4021  protein of unknown function DUF156  37.04 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.359633 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1694  protein of unknown function DUF156  37.31 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.656008  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  30.59 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0914  hypothetical protein  38.81 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  35.09 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  32.26 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  40 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  41.18 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  36.84 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2536  protein of unknown function DUF156  35.37 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157002  normal  0.182354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  36.84 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  36.84 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  36.84 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0952  hypothetical protein  34.29 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  35.71 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1454  hypothetical protein  38.57 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1472  hypothetical protein  38.57 
 
 
109 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0120  hypothetical protein  28.95 
 
 
91 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  27.38 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  38.46 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>