188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2087 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.0236957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2226  hypothetical protein  92.13 
 
 		 89 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.366789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3082  hypothetical protein  64.04 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  67.42 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1899  hypothetical protein  65.52 
 
 		 87 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  70 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1211  hypothetical protein  67.47 
 
 		 83 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1705  protein of unknown function DUF156  71.01 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0837339  normal  0.822352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4026  hypothetical protein  58.23 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.363044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5694  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0982  hypothetical protein  54.44 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11794  hypothetical protein  56.96 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113188  hitchhiker  0.00000461883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5315  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  50.5 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5404  hypothetical protein  51.69 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0597506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4017  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  53.33 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  52.81 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4092  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1827  hypothetical protein  53.33 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.573125  normal  0.937495 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0202  protein of unknown function DUF156  52.81 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4247  hypothetical protein  52.81 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0834  protein of unknown function DUF156  55.26 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  51.69 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  47.25 
 
 		 90 aa  87  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  49.43 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0356  protein of unknown function DUF156  43.82 
 
 		 88 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1970  protein of unknown function DUF156  52.56 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3832  hypothetical protein  53.85 
 
 		 85 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  43.82 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21650  hypothetical protein  55.7 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  43.82 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0154  protein of unknown function DUF156  46.59 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.98123  normal  0.760609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  44.87 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28120  hypothetical protein  53.23 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  43.59 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2895  protein of unknown function DUF156  39.02 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  38.67 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0760  protein of unknown function DUF156  35.9 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.22347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0560  protein of unknown function DUF156  39.73 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00625048  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  41.82 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2639  protein of unknown function DUF156  44.23 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.975232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  40.98 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  32.89 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  52  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  32.89 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2968  hypothetical protein  32.1 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  45.28 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0558  hypothetical protein  47.06 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.986743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  36.25 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  35.44 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  32.39 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  32.39 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  31.58 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  31.65 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  32.94 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  39.13 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  42.59 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4279  hypothetical protein  43.4 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  33.77 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  43.86 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  43.4 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  36.14 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  33.9 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  34.12 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3194  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3410  hypothetical protein  35 
 
 		 93 aa  47.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.480175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5612  hypothetical protein  38.98 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.792267 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  33.77 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0023  hypothetical protein  32.84 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2932  hypothetical protein  41.51 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0695526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  41.82 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3746  hypothetical protein  42.59 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1883  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.512687 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3648  protein of unknown function DUF156  33.77 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4727  protein of unknown function DUF156  43.64 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.641634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  33.73 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3583  protein of unknown function DUF156  33.77 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  46 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0784  protein of unknown function DUF156  36.62 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.63261  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  36.36 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2241  protein of unknown function DUF156  40 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>